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标题: 高斯在内坐标下如何增加一个原子不相连接的二面角 [打印本页]

作者
Author: yzh 时间: 2026-3-9 11:24
标题: 高斯在内坐标下如何增加一个原子不相连接的二面角
本帖最后由 yzh 于 2026-3-9 11:26 编辑

请教一下各位老师：
需要在g16中的内坐标模式下，手动自定义增加一个二面角，如何实现。

需要对分子1进行刚性二面角N3-C6-N2-C82扫描，但是内坐标模式下没有这个二面角（这4个原子是不连接的），请问通过什么方法能够手动自定义增加这个二面角。

谢谢！ (, 下载次数 Times of downloads: 12)

作者
Author: wal 时间: 2026-3-9 11:52
用gentor生成轨迹，直接算单点

作者
Author: yzh 时间: 2026-3-9 12:07

wal 发表于 2026-3-9 11:52
用gentor生成轨迹，直接算单点

ok，这也是一个好方法，请问在高斯中如何自定义增加这个二面角呢？谢谢

作者
Author: 北大-陶豫 时间: 2026-3-9 13:50
就直接定义就行了吧，比如扫6步、步长30度，就这么写：
D 3 6 2 82 S 6 30.00

作者
Author: yzh 时间: 2026-3-9 14:17

北大-陶豫发表于 2026-3-9 13:50
就直接定义就行了吧，比如扫6步、步长30度，就这么写：
D 3 6 2 82 S 6 30.00

...

柔性扫描可以这样定义，g16可以直接设定。但是刚性扫描需要在内坐标下设定，好像不能这样设定。

作者
Author: sobereva 时间: 2026-3-11 06:38

yzh 发表于 2026-3-9 12:07
ok，这也是一个好方法，请问在高斯中如何自定义增加这个二面角呢？谢谢

你需要自己调内坐标定义，相当麻烦。按下文借助gentor解决当前问题就完了，最简单
详谈使用Gaussian做势能面扫描
http://sobereva.com/474（http://bbs.keinsci.com/thread-12660-1-1.html）

作者
Author: yzh 时间: 2026-3-11 08:34

sobereva 发表于 2026-3-11 06:38
你需要自己调内坐标定义，相当麻烦。按下文借助gentor解决当前问题就完了，最简单
详谈使用Gaussian做势 ...

谢谢老师，我明白了，根据二面角度数生成多个构象，做单点能

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