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标题: 请教探讨小分子在蛋白质有哪些结合位置和SDF的问题 [打印本页]

作者
Author: azero 时间: 2026-3-10 12:51
标题: 请教探讨小分子在蛋白质有哪些结合位置和SDF的问题
研究的有机溶剂小分子破坏蛋白质结构导致其失活的研究，想探讨小分子在蛋白质有哪些结合位置。
①MD中SDF表示的是分布概况，那SDF很高的地方，是表示这是有机溶剂小分子的结合位点么。
②如果我后续做有机溶剂小分子-蛋白复合晶体验证结合位点是否有意义

作者
Author: sobereva 时间: 2026-3-11 07:11
把配体的sdf等值面图和蛋白质结构一起显示出来，自然能判断意味着什么。如果蛋白质的原子也围着sdf很高的区域，明显暗示那里是动力学上相对稳定的结合区域
能搞出来晶体自然应当搞

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