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标题: 拟合二面角参数，初始构型原子间距过近 [打印本页]

作者
Author: milliliter 时间: 2026-3-10 23:07
标题: 拟合二面角参数，初始构型原子间距过近
对该分子的二面角从0度扫到180度进行柔性扫描时（后续要拟合MD中力场的二面角参数），0度会导致分子初始构型原子间距过近，gauss报错：
1.请问老师们，是否一定要扫描0度构型的势能面？
2.如果要对该分子拟合二面角参数，势能面扫描该如何进行？
希望老师们指点一下，非常感谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2026-3-11 06:17
看不出你这是什么结构。给个极小点结构的图
注意做柔性扫描前应当把复杂体系恰当简化，使得扫描的曲线基本只反映那一个键旋转本身带来的能量变化，而尽可能避免周围的基团产生的影响。比如GLYCAM对糖涉及的一种二面角扫描时用的模型体系：
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