计算化学公社

标题: 求助使用dimer方法搜索过渡态时能量突然上升的问题 [打印本页]

作者
Author:
shibanfish    时间: 2026-3-11 16:37
标题: 求助使用dimer方法搜索过渡态时能量突然上升的问题
各位老师好,最近我在用dimer搜索Pt表面氧分子分解的过渡态,但是在过程中一开始能量下降,后来能量一直升高,几何优化也不收敛,我把有问题的优化步的RESTART文件和其他文件上传了,麻烦老师们看一下问题出在哪里

作者
Author:
sobereva    时间: 2026-3-12 07:31
这种事一律要用VMD里显示优化轨迹来判断情况、收敛趋势
搜索过渡态没必然性非得能量单调下降,毕竟不是优化极小点
作者
Author:
shibanfish    时间: 2026-3-12 09:17
sobereva 发表于 2026-3-12 07:31
这种事一律要用VMD里显示优化轨迹来判断情况、收敛趋势
搜索过渡态没必然性非得能量单调下降,毕竟不是优 ...

好的卢老师,我还想问一下,我之前搜索Pt表面氧分子分解过渡态的时候虚频不对,后来我对初始结构做了振动分析,发现最大虚频就是我要的振动方向,然后我就把这个虚频对应的振动模式作为dimer的移动方向了(具体做法就是将mol文件中的振动对应的那一串坐标复制出来),请问这样做有助于过渡态搜索收敛吗?后续还需不需要再调整?
作者
Author:
sobereva    时间: 2026-3-13 23:16
shibanfish 发表于 2026-3-12 09:17
好的卢老师,我还想问一下,我之前搜索Pt表面氧分子分解过渡态的时候虚频不对,后来我对初始结构做了振动 ...

应当把这个振动矢量作为dimer的初始朝向,而不是dimer移动方向(本来移动方向也不是能自己设的)




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3