计算化学公社

标题: VMD里给相互作用的两个分子分别用两种显示方式和颜色应该怎么做呢？ [打印本页]

作者
Author: 微塑料 时间: 2026-3-11 20:36
标题: VMD里给相互作用的两个分子分别用两种显示方式和颜色应该怎么做呢？
各位老师好，我想用VMD画一个这样的图 (, 下载次数 Times of downloads: 32) ，即给相互作用的两个分子分别用两种显示方式和颜色。应该怎么做呢？

作者
Author: Diotima 时间: 2026-3-11 20:53
分组着色。

作者
Author: student0618 时间: 2026-3-11 21:01
例如一个用 name, 一个用type, 然后color那边分别改 name 和type对应原子的颜色。

作者
Author: sobereva 时间: 2026-3-12 07:17
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问，并清楚、准确反映出帖子具体内容，避免有任何歧义和含糊性，仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “VMD调色” 改了，以后务必注意！下次将删帖+扣分处理。

当前问题和波函数分析、Multiwfn毫无直接联系，别随便发到波函数分析与Multiwfn版块，这次给你移动了，以后注意！

作者
Author: pal 时间: 2026-3-12 09:13
两个分子分成两个pdb，分别载入

作者
Author: 微塑料 时间: 2026-3-12 09:58
本帖最后由微塑料于 2026-3-12 10:01 编辑

如何单独改变以VDW方式（看起来很粗的分子）显示的分子的颜色呢？比如把单独把这个长链（粗的分子）的碳原子的颜色改成黄色，H原的颜色改成蓝绿色， (, 下载次数 Times of downloads: 24) ，让这个体系不会有那么多原子重叠。

作者
Author: student0618 时间: 2026-3-12 11:48

微塑料发表于 2026-3-12 09:58
如何单独改变以VDW方式（看起来很粗的分子）显示的分子的颜色呢？比如把单独把这个长链（粗的分子）的碳原 ...

VDW那个的Coloring method换 type，Main选单Graphics - Color 弹出的视窗找type换掉C H的颜色。

作者
Author: 微塑料 时间: 2026-3-12 17:36

student0618 发表于 2026-3-12 11:48
VDW那个的Coloring method换 type，Main选单Graphics - Color 弹出的视窗找type换掉C H的颜色。

非常感谢，十分有效

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