计算化学公社

标题: molclus+gaussian优化的时候，报错Error: segmentation violation [打印本页]

作者
Author: zylaaa 时间: 2026-3-13 16:20
标题: molclus+gaussian优化的时候，报错Error: segmentation violation
老师们好，请问一下大家，我在测试molclus+gaussian优化的时候，发现一直报错。例子是用的sob老师讲“”使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索“”知识中的3.5 molclus+Gaussian做优化下的molclus_G09_M062X_6-31Gx.rar文件。在测试的时候发现报错如下1的问题。随后跑作业时替换了为settings2.ini文件（为molclus_1.13_Linux解压包中的settings.ini的文件同时修改了对应的iprog，gaussian_path，igaucontinue，），出现了如下2的报错，想着是内存的问题，但是关于template.gif文件中的%nprocs和%mem也测试了改大一些和小一些（16和60GB、4和10GB），但是依旧报错，看到这个报错“Error: Optimization did not normally finish!The optimization failed because number of allowed steps is exceeded. Generate new gau.gjf with the last unconverged geometry based on template2.gjf”想着是template2.gif中的maxstep=2设置的较小，也改大了一些进行测试依旧报这样的错误。

作者
Author: sobereva 时间: 2026-3-14 08:06
molclus把每一步干的事、调用计算程序运行的命令都明确给出了，按照基本逻辑排查和解决就完了
像是这个提示，明显就是g16运行gau.gjf出错，显然应该打开gau.out看到底是什么问题、反复调试确保手动运行截图里相同的g16命令没问题然后再用molclus跑。如果搞不明白就应当把gau.gjf和gau.out上传，因为这是和报错关系最直接的文件
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作者
Author: zylaaa 时间: 2026-3-14 08:47
老师您看一下，这个是gif和out文件

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Author: zylaaa 时间: 2026-3-14 09:39
本帖最后由 zylaaa 于 2026-3-14 09:41 编辑

sobereva 发表于 2026-3-14 08:06
molclus把每一步干的事、调用计算程序运行的命令都明确给出了，按照基本逻辑排查和解决就完了
像是这个提 ...

老师，这个运行完之后gif和out都被删掉了，我截取了一下中间过程中生成的gif和out文件您看一下，我自己有点没看明白倒是是啥错误。但是最后倒是也有isomers.xyz生成，不知道这种情况是啥意思了。 (, 下载次数 Times of downloads: 0) (, 下载次数 Times of downloads: 1) (, 下载次数 Times of downloads: 0) (, 下载次数 Times of downloads: 0) (, 下载次数 Times of downloads: 0) (, 下载次数 Times of downloads: 0) (, 下载次数 Times of downloads: 1)

作者
Author: sobereva 时间: 2026-3-15 02:44

zylaaa 发表于 2026-3-14 08:47
老师您看一下，这个是gif和out文件

那叫gjf
没事甭在opt里写tight，会导致总耗时比默认高很多，而且明显更难达到收敛限
你的.out文件不完整没法判断（settings.ini里ibkout设1可以保留每个体系的out文件），但几何优化任务最后能看到l9999报错几乎一定是几何优化没收敛所致，参考下文量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法
http://sobereva.com/164

作者
Author: zylaaa 时间: 2026-3-16 09:09

sobereva 发表于 2026-3-15 02:44
那叫gjf
没事甭在opt里写tight，会导致总耗时比默认高很多，而且明显更难达到收敛限
你的.out文件不完 ...

好的，感谢老师！

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