标题: 在自己服务器上运行sobEDA.sh时报错 [打印本页] 作者Author: 洛洛 时间: 2026-3-16 11:06 标题: 在自己服务器上运行sobEDA.sh时报错 各位大佬好,我在自己服务器上做sobEDA时运行了一秒就报错了,fragment1.out里只有这几行
FIO/stdio: No such file or directory
FIO-F-/OPEN/unit=11/error code returned by host stdio - 2.
File name = /data/123/Gau-167938.inp
In source file ml0.f, at line number 197
终端里提示是这样的,似乎分完片段就停止运行了
[root@y1 35]# ./sobEDA.sh
Number of fragments: 2
Charge and spin multiplicity of fragment 1: 0 1
Indices of atoms in fragment 1: 1-40
Generating Gaussian input file of fragment 1 via Multiwfn (fragment1.gjf)
Running: g16 < fragment1.gjf &> fragment1.out
Error encountered, please check corresponding output file! Now script exits
作者Author: sobereva 时间: 2026-3-16 11:52
先确保g16自己手动做常规计算没问题。如果没问题,再检查fragment1.gjf和fragment1.out的内容,结合Gaussian使用常识判断是什么情况作者Author: 洛洛 时间: 2026-3-16 15:30
sob老师,g16手动计算时没问题的,gjf文件也没什么异常out文件就主贴显示的那几行,一年前我做sobEDA的时候没什么问题,于是刚刚我把那个文件也拿来试了一遍,结果发现也报错了,是不是服务器的问题呢,但是我做其他的任何分析都是正常的作者Author: sobereva 时间: 2026-3-18 06:12
FIO/stdio: No such file or directory
FIO-F-/OPEN/unit=11/error code returned by host stdio - 2.
File name = /data/123/Gau-168638.inp
In source file ml0.f, at line number 197
这种提示明显是运行环境问题。诸如提示里的目录在实际做这个计算的机子上没有文件写入权限