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标题: 进行scan断裂O-O键后对能量最低的中间体进行结构优化后O-O又重新连接 [打印本页]

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朱佳慧    时间: 2026-3-18 14:49
标题: 进行scan断裂O-O键后对能量最低的中间体进行结构优化后O-O又重新连接
我想请教各位老师们!我的体系是一个双铁酶,使用Turbomole软件做QM/MM计算。反应第一步需要断裂O-O键,scan经过了16kcal/mol的能垒后,得到能量最低的结构,准备作为下一步的中间体IM1。现在对这个中间体IM1进行结构优化得到的结果为:原本IM1的O-O键为2.7埃,结构优化后O-O键又重新回到1.4埃(O-O键断裂的过渡态大概是1.6埃的键长)。我想请问各位老师,可能有什么原因会导致这个情况出现呢?是我的参数设置有问题吗?感谢各位老师的解答!!!




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zjxitcc    时间: 2026-3-18 15:18
解离后,例如O-O键长2.7 A附近的结构,应当确保两个目标O原子具有符号相反、数值大小几乎相等的自旋布居,例如±0.8。另外注意两个Fe原子是否存在反铁磁耦合的3d电子。
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朱佳慧    时间: 2026-3-19 14:35
zjxitcc 发表于 2026-3-18 15:18
解离后,例如O-O键长2.7 A附近的结构,应当确保两个目标O原子具有符号相反、数值大小几乎相等的自旋布居, ...

感谢老师的解答!我去检查一下




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