计算化学公社

标题: 利用TRAIVS结合REFTRAJ计算熔盐拉曼光谱出现modified ACTION attribute WRITE错误。 [打印本页]

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Author: KaZikl 时间: 2026-3-18 19:31
标题: 利用TRAIVS结合REFTRAJ计算熔盐拉曼光谱出现modified ACTION attribute WRITE错误。
本帖最后由 KaZikl 于 2026-3-18 19:51 编辑

各位老师好，我使用TRAVIS结合CP2K，使用REFTRAJ计算熔盐拉曼光谱，出现如下错误，输入文件和输出文件附于下方，请求各位老师指点迷津！[attach]128672[/attach],图片中是20Al-pos-1.xyz

各位老师好，目前此问题已解决！

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2026-3-18 20:23
看来还得加个特殊的终止逻辑与警告信息，触发于设置了&MOTION/&MD/&REFTRAJ/TRAJ_FILE_NAME读已有轨迹文件、没有显式设置&MOTION/&PRINT/&TRAJECTORY/FILENAME输出新轨迹文件、且前者与后者默认设置重名的情况。

顺便提醒一句，这样重跑轨迹得到2000个电子密度的cube文件非常吃硬盘空间和读写速度，在CP2K工具链装有libvori时可以考虑换用E_DENSITY_BQB关键词直接输出bqb格式的TRAVIS的输入文件，不一定要先输出cube再压缩。

作者
Author: KaZikl 时间: 2026-3-18 22:18
本帖最后由 KaZikl 于 2026-3-18 22:25 编辑

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2026-3-18 20:23
看来还得加个特殊的终止逻辑与警告信息，触发于设置了&MOTION/&MD/&REFTRAJ/TRAJ_FILE_NAME读已有轨迹文件 ...

老师，感谢您的回复，我也很奇怪的就是
按照Computing Bulk Phase Vibrational Spectra*with CP2k and TRAVIS (2018)这个教程给出的CP2K运行代码就可以运行，但是改为自己的文件名就不行，我检查了一下，和教程就差了一个&GLOBLE中的FFTW_PLAN_TYPE EXHAUSTIVE；以及文件的名字，请问这个如果要设置自己的文件名，要在&MOTION/&PRINT/&TRAJECTORY/FILENAME中再给出一个新的轨迹名称吗？
关于您提到的直接转为BQB格式，感谢老师的指点！我想请问一下，为了跑这个我已经在云计算安装了CP2K2026.01，如果再添加libvori 需要重新进行编译吗？

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2026-3-18 23:37

KaZikl 发表于 2026-3-18 22:18
老师，感谢您的回复，我也很奇怪的就是
按照Computing Bulk Phase Vibrational Spectra*with CP2k and T ...

最简单的办法就是把&GLOBAL/PROJECT_NAME定的全局任务名字改成别的，因为&MOTION/&PRINT/&TRAJECTORY/FILENAME的默认输出文件名就是这个名字加-pos-1.xyz后缀。如果不想再输出一次和REFTRAJ一致的轨迹文件，可以把&MOTION/&PRINT/&TRAJECTORY设为OFF有意关闭。

如果CP2K是用toolchain配的依赖，那应该默认安装了libvori的，跑任务的输出文件"CP2K| cp2kflags"这一行链接库名称里有libvori和libbqb可以确认。

作者
Author: KaZikl 时间: 2026-3-19 02:17

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2026-3-18 23:37
最简单的办法就是把&GLOBAL/PROJECT_NAME定的全局任务名字改成别的，因为&MOTION/&PRINT/&TRAJECTORY/FIL ...

好的谢谢老师

作者
Author: KaZikl 时间: 2026-3-19 20:05

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2026-3-18 23:37
最简单的办法就是把&GLOBAL/PROJECT_NAME定的全局任务名字改成别的，因为&MOTION/&PRINT/&TRAJECTORY/FIL ...

老师，关于您昨天说的方法，我已经找到了方法进行输出，但是却提示我LIBVORI没有成功安装，可否请老师移步我的新帖子指点一下。

作者
Author: KaZikl 时间: 2026-3-24 01:27
本帖最后由 KaZikl 于 2026-3-24 17:33 编辑

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2026-3-18 20:23
看来还得加个特殊的终止逻辑与警告信息，触发于设置了&MOTION/&MD/&REFTRAJ/TRAJ_FILE_NAME读已有轨迹文件 ...

老师，目前我已经跑完得到了bqb文件，但是在载入TRAVIS，按照教程来得到光谱时，TRAVIS的教程可以输入all,但是我在输入时却提示如下错误，不知道老师是否遇到过这个问题，目前我搜索了公社和Google都没有搜到相关的问题，不知道是不是在windows下使用的原因还是，请老师赐教！

您好老师，已经解决了，直接按ENTER是可以直接以推荐设置运行的

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