计算化学公社

标题: 关于使用orca做磷杂peterson烯化过程AIMD分析的问题 [打印本页]

作者
Author: albertpu 时间: 2026-3-19 22:59
标题: 关于使用orca做磷杂peterson烯化过程AIMD分析的问题
最近我在研究如下图所示的一个磷杂peterson烯化过程，通过柔性扫描和IGMH分析，我们相信该步骤是一个无TS的过程，并且O与Si之间的弱相互作用力是该反应的关键。
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我们决定使用使用ORCA做从头算动力学(AIMD)的简单例子 - 思想家公社的门口：量子化学·分子模拟·二次元的方法，对该反应进行动力学计算，得到了O与Si的距离和P与C的距离随时间变化的折线图。我了解到，orca会根据系统时间对各个原子初始速度进行初猜，想问一下，通过投多个AIMD 任务，计算不同初猜下该反应键长的变化是否具有科学意义？如果需要，大概多少条反应路径够呢？
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作者
Author: sobereva 时间: 2026-3-19 23:55
那不叫初猜，而是对初速度进行随机初始化

如果你想体现反应过程很快，跑5条轨迹，如果都是这个结论，就足够说明问题

作者
Author: albertpu 时间: 2026-3-20 08:17

sobereva 发表于 2026-3-19 23:55
那不叫初猜，而是对初速度进行随机初始化

如果你想体现反应过程很快，跑5条轨迹，如果都是这个结论，就 ...

好的好的！感谢老师

作者
Author: wzkchem5 时间: 2026-3-20 08:54
这反应式的氢数和电荷数都不守恒啊

作者
Author: albertpu 时间: 2026-3-20 10:27

wzkchem5 发表于 2026-3-20 08:54
这反应式的氢数和电荷数都不守恒啊

只是示意老师，实际反应有强碱拔氢，同样感谢老师回答！

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