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标题: MS建孪晶,具有坐标的原子数和总原子数不对应 [打印本页]

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科沃尔    时间: 2026-3-20 21:20
标题: MS建孪晶,具有坐标的原子数和总原子数不对应
本帖最后由 科沃尔 于 2026-3-21 09:45 编辑

大家好。我是一名MS的初学者,目前在建模中遇到了MS建孪晶的时候,输出的cif格式时,具有坐标信息的原子数和模型原子总数不对应,请问这种情况应该怎么解决呢,我在ms中也选择P1了,但是输出的原子坐标信息还是不全。非常谢谢!
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pal    时间: 2026-3-21 08:50
建议提供原文件,大概率是因为周期性重复,所以看图时候的原子多于输出的原子
作者
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科沃尔    时间: 2026-3-21 09:29
pal 发表于 2026-3-21 08:50
建议提供原文件,大概率是因为周期性重复,所以看图时候的原子多于输出的原子

您好,我根据的您的想法看了模型,发现是周期性重复。在跑vasp时候,是用具有坐标信息的原子数,还是说要用模型中所有原子数的坐标呢。目前我还没找到在哪里提交源文件,后面找到会提交。非常感谢
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科沃尔    时间: 2026-3-21 09:47
pal 发表于 2026-3-21 08:50
建议提供原文件,大概率是因为周期性重复,所以看图时候的原子多于输出的原子

您好,我已经上传了,麻烦您了
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pal    时间: 2026-3-21 10:28
科沃尔 发表于 2026-3-21 09:29
您好,我根据的您的想法看了模型,发现是周期性重复。在跑vasp时候,是用具有坐标信息的原子数,还是说要 ...

用输出的文件里的坐标,在ms里依次设置display style-lattice-style-original,看到的原子数和文件里的原子数应该是一样的




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