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标题: 求助：Amber99sb和GAFF2力场混用是否是最好的解决办法 [打印本页]

作者
Author: 陈欣羽 时间: 2026-3-24 10:52
标题: 求助：Amber99sb和GAFF2力场混用是否是最好的解决办法
阴离子聚合物溶液的模拟，使用GAFF2+RESP+TIP4P-ICE组合。
问题1：GAFF2使用sobtop可生成阴离子聚合物的top和itp文件，但做空白实验时（只有水或者水和金属离子），是否可以在拓扑文件中引用Amber99sb.ff/forcefield.itp和Amber99sb.ff/ions.itp，因为我主要还是想使用GAFF2力场，不知道这种混用是否是最好的办法，或者有更好的代替AMBER99SB的力场。
问题2：TIP4P-ICE是显式溶剂模型，我在计算RESP电荷时是否应该完全在真空中计算，以保证TIP4P-ICE不带来对阴离子聚合物“双重极化”，过度亲水的问题

作者
Author: sobereva 时间: 2026-3-25 02:43
1 可以，你引用其它的AMBER力场文件也都一样，因为描述阴离子部分根本不用到里面提供的参数

2 模拟溶液干嘛用专门适合描述冰点附近的TIP4P-ICE？若无特殊情况，用OPC好得多
避免溶剂的极化效应描述过头就用RESP2(0.5)
RESP2原子电荷的思想以及在Multiwfn中的计算
http://sobereva.com/531（http://bbs.keinsci.com/thread-16190-1-1.html）

作者
Author: 陈欣羽 时间: 2026-3-25 10:32

sobereva 发表于 2026-3-25 02:43
1 可以，你引用其它的AMBER力场文件也都一样，因为描述阴离子部分根本不用到里面提供的参数

2 模拟溶液 ...

感谢老师的解答，我使用TIP4P-ICE模型确实是有特殊的情况。我会改用RESP2(0.5)来计算电荷，再次谢谢sob老师

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