计算化学公社

标题: 求助：关于聚合物链体系的拉伸模拟的疑问 [打印本页]

作者
Author: Lisy 时间: 2026-3-24 19:03
标题: 求助：关于聚合物链体系的拉伸模拟的疑问
我用gromacs进行聚合物链体系的拉伸模拟，采用NPT系综，半各项异性控压，为什么拉伸模拟后只是盒子被拉长了，聚合物链并没有被拉长呢

作者
Author: KazusaT 时间: 2026-3-24 19:20
你的mdp文件里没有任何Pull code。
https://manual.gromacs.org/current/reference-manual/special/pulling.html

作者
Author: student0618 时间: 2026-3-24 22:37
是想用deform吗？

作者
Author: Lisy 时间: 2026-3-24 22:47

student0618 发表于 2026-3-24 22:37
是想用deform吗？

对的，设置了deform信息

作者
Author: sobereva 时间: 2026-3-25 02:56
聚合物分子之间有显著的吸引相互作用，盒子太大时显然还是会凝聚到一起，其分布区域不可能始终随着盒子增大而增大并且密度线性下降（除非那是气体）

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