计算化学公社

标题: 如何加快dimer计算的收敛速度?跑了一天,仍旧离收敛限比较远 [打印本页]

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Ying_Zhang    时间: 2026-3-24 21:33
标题: 如何加快dimer计算的收敛速度?跑了一天,仍旧离收敛限比较远
各位老师,给一下意见,如何加快dimer的计算速度。
1. 先进行了CI-NEB(PBE/DZVP)的计算,提取过渡态结构。
2. 进行过渡态的振动分析(PBE/DZVP),发现仅有一个虚频(-1389.814687 (cm^-1) ),且振动模式对应反应路径,提取虚频下的正则坐标。
3. 进行过渡态的dimer计算(PBE/DZVP),将正则坐标手动输入,下面是dimer的输入文件。

请问大家有什么建议,可以提升收敛速度,跑了一天,仍旧离收敛限比较远。

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sobereva    时间: 2026-3-25 02:59
DZVP-MOLOPT-SR-GTH绝对不要简单写成DZVP,有极大歧义
你的盒子和体系完全不对应,Multiwfn载入你的inp文件后进入主功能0一看便知,这是最显而易见的硬伤
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Ying_Zhang    时间: 2026-3-25 17:50
sobereva 发表于 2026-3-25 02:59
DZVP-MOLOPT-SR-GTH绝对不要简单写成DZVP,有极大歧义
你的盒子和体系完全不对应,Multiwfn载入你的inp文 ...

感谢sob老师回复,这个inp中的盒子,是我基于CI-NEB计算,提取的过渡态结构,拿Multiwfn生成dimer的输入文件时,它自动生成的。下面是过渡态的结构文件(TS.xyz)。那请问一下老师:
1)这种体系和盒子不一致对计算有什么影响?
2)如何修改这个盒子的尺寸,与计算体系适配?

感谢sob老师回复

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northern_mar    时间: 2026-3-25 18:47
本帖最后由 northern_mar 于 2026-3-25 19:01 编辑
Ying_Zhang 发表于 2026-3-25 17:50
感谢sob老师回复,这个inp中的盒子,是我基于CI-NEB计算,提取的过渡态结构,拿Multiwfn生成dimer的输入 ...

2)手动打开xyz文件,输入晶胞信息。下面的是我之前做的,在第二行加入晶胞信息即可。
   166
Tv_1:  16.246300   0.000000   0.000000 Tv_2:   0.000000  20.821800   0.000000 Tv_3:   0.000000   0.000000  23.751900
Zn      1.62463000      0.00000000      0.00000000
Zn      0.00000000      0.00000000      2.81388759
O       1.62463000      1.99160517      0.00000000
O       0.00000000      1.99160517      2.81388759
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Ying_Zhang    时间: 2026-3-25 20:41
northern_mar 发表于 2026-3-25 18:47
2)手动打开xyz文件,输入晶胞信息。下面的是我之前做的,在第二行加入晶胞信息即可。
   166
Tv_1:   ...

哦哦 感谢 我直接在inp文件修改了
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sobereva    时间: 2026-3-26 03:48
Ying_Zhang 发表于 2026-3-25 17:50
感谢sob老师回复,这个inp中的盒子,是我基于CI-NEB计算,提取的过渡态结构,拿Multiwfn生成dimer的输入 ...

由于CI-NEB计算过程中晶胞不会变,所以最简单的做法就是把CI-NEB的inp文件里的晶胞信息直接复制到Multiwfn新产生的dimer任务的输入文件里

盒子信息不对,则体系的周期性、所处状态完全都是错的,结果毫无意义,并且此时体系处于奇怪的电子结构,往往SCF也极难收敛
作者
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Ying_Zhang    时间: 2026-3-26 04:24
sobereva 发表于 2026-3-26 03:48
由于CI-NEB计算过程中晶胞不会变,所以最简单的做法就是把CI-NEB的inp文件里的晶胞信息直接复制到Multiwf ...

哦哦 好的 感谢sob老师




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