计算化学公社
标题:
在Multiwfn中如何载入盒子信息之后再载入cube文件进行分析?
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作者Author:
以玉名诗
时间:
2026-3-25 14:37
标题:
在Multiwfn中如何载入盒子信息之后再载入cube文件进行分析?
请教各位老师!我现在想要使用cp2k的AIMD过程输出电子密度的cube文件,用来分析AIM电荷,但是发现原子都跑出了盒子。现在想先载入有盒子信息的restart文件,将原子卷入盒子,然后再载入cube文件进行分析。请问老师在Multiwfn中怎么先载入结构文件再载入cube文件呢?由于文件过大,以网盘形式给出。
通过网盘分享的文件:file.zip
链接:
https://pan.baidu.com/s/1GWOqcetdKSPdUwnBvLZDvw
提取码: z96z
作者Author:
Stardust0831
时间:
2026-3-25 16:28
本帖最后由 Stardust0831 于 2026-3-25 16:30 编辑
卷入盒子这个操作直接改cube文件本身就行,我在你初次提出这个问题的帖子
http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 56187&fromuid=58653
里已经讲过原子坐标如何被记录在cube文件中了,你应该可以轻松写出python脚本实现这一修改。
cube文件本身有格点数据的周期性信息,我感觉Multiwfn可能已经有过这方面的考量,毕竟你当前使用场景的格点的box和原子的box通常是一样的。
作者Author:
sobereva
时间:
2026-3-26 03:24
产生cube文件用的盒子和晶胞很可能并不一致,所以Multiwfn默认不会从cube文件里读取盒子信息。
Multiwfn载入cube文件后,用主功能1000里的这个选项可以把cube文件的盒子作为晶胞信息
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作者Author:
以玉名诗
时间:
2026-3-30 09:42
sobereva 发表于 2026-3-26 03:24
产生cube文件用的盒子和晶胞很可能并不一致,所以Multiwfn默认不会从cube文件里读取盒子信息。
Multiwfn载 ...
我明白了,谢谢sob老师!
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