计算化学公社

标题: 求助计算Cd和络合物配位的基组选择 [打印本页]

作者
Author: songzihao0307 时间: 2026-3-26 19:29
标题: 求助计算Cd和络合物配位的基组选择
各位老师，我想用MS2020的DMol3模块计算Cd和络合物不同位点的配位键键能，进而确定溶液中配合物的实际存在形式。目前计划使用GGA-PBE泛函+Grimme色散校正和DNP4.4基组先对配合物进行几何结构优化，然后再使用M06-2X+TNP进行单点能计算，进而推算出键能。我看论坛上大部分老师用的是Gaussian而非MS，所以我也有点犯怵，想请问各位老师，这个泛函和基组设置的合理吗，是否应该改用Gaussian计算？谢谢各位老师！

作者
Author: Stardust0831 时间: 2026-3-27 05:07
不应当在除了建模以外的任何情况使用M$，具体可以看《为什么我非常不建议购买和使用D摩3量子化学程序》。
用高斯即可。至于计算级别的选择可以看这篇入门帖的末尾提及的博文《谈谈学量子化学如何正确地入门》

作者
Author: sobereva 时间: 2026-3-27 05:47
Dmol3用M06-2X之类杂化泛函远比Gaussian慢，还卖得极贵，正经做量化的谁用这个。用这个的大部分都是业余外行群体
用Gaussian对此体系做优化任务建议用B3LYP，单点M06-2X可以。用什么基组合适必须对体系有完整的交代才能告诉你，至少说清楚有多少原子、什么元素，并且说清楚计算机配置情况

作者
Author: songzihao0307 时间: 2026-3-27 08:51

Stardust0831 发表于 2026-3-27 05:07
不应当在除了建模以外的任何情况使用M$，具体可以看《为什么我非常不建议购买和使用D摩3量子化学程序》。
...

好的，谢谢老师！

作者
Author: songzihao0307 时间: 2026-3-27 08:58
谢谢卢老师，我的结构是Cd和4个或者6个DMH分子的配位，一共有20个碳，28个氢，8个氧，8个氮和一个镉

作者
Author: songzihao0307 时间: 2026-3-27 09:01

sobereva 发表于 2026-3-27 05:47
Dmol3用M06-2X之类杂化泛函远比Gaussian慢，还卖得极贵，正经做量化的谁用这个。用这个的大部分都是业余外 ...

谢谢卢老师！抱歉我在回复里面不太会插图片，就单独发了一个回复描述了结构。目前我计划用Gaussian来算了，服务器配置是2*Intel Xeon Gold 6330，256G，目前用的人比较少，6个节点每个节点分配56核心，基本可以同时占用3-4个节点

作者
Author: sobereva 时间: 2026-3-27 09:30

songzihao0307 发表于 2026-3-27 09:01
谢谢卢老师！抱歉我在回复里面不太会插图片，就单独发了一个回复描述了结构。目前我计划用Gaussian来算了 ...

opt freq过程：Cd用SDD，其它用6-31G*或再略好一点的6-311G*
单点任务：都用def2-TZVP

作者
Author: songzihao0307 时间: 2026-3-27 09:34

sobereva 发表于 2026-3-27 09:30
opt freq过程：Cd用SDD，其它用6-31G*或再略好一点的6-311G*
单点任务：都用def2-TZVP

感谢卢老师！！

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)