计算化学公社
标题:
求助NO2+进攻乌洛托品过程,柔性扫描应该怎么定位特定的C-N断裂?
[打印本页]
作者Author:
freshman234
时间:
2026-3-27 10:48
标题:
求助NO2+进攻乌洛托品过程,柔性扫描应该怎么定位特定的C-N断裂?
在复现一篇文献的乌洛托品(六亚甲基四胺
)硝解反应的DFT计算,在复现过程中,我使用了与文章中相同的初始结构(乌洛托品,由剑桥晶体学数据中心获得)、理论方法和基组(m062x/6-311G(d)),引入了SMD模型来模拟发烟硝酸环境。然而,经过很多尝试,我找到的过渡态虚频(-363 cm-1,文章中是-317cm-1)以及后续IRC两端优化的反应物与产物的E+ZPE差值(shermo程序计算)与文章结果存在较大偏差,由于此前是根据文献图片手搭的,所以怀疑是过渡态初猜结构没有搭好,现在想尝试柔性扫描帮忙找过渡态。
柔性扫描思路是让硝化剂NO2+去靠近乌洛托品中的N原子,把NO2+与N原子距离从1.5扫到1.3埃,但结果是能量一直在增长(文献里过渡态时的距离是1.4埃),并且乌洛托品的三个C-N键同时拉长且没有一个是显著于其它两个拉长的,这与文献仅断裂一个C-N键不符,求助大佬们这种硝解反应应该怎么设置柔性扫描?
作者Author:
wzkchem5
时间:
2026-3-27 13:32
仔细阅读
http://sobereva.com/678
欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)
Powered by Discuz! X3.3