计算化学公社

标题: 如何用LIIC方法猜想圆锥交叉CI点 [打印本页]

作者
Author: xiaohuo 时间: 2026-3-28 11:22
标题: 如何用LIIC方法猜想圆锥交叉CI点
各位老师好，我想用文献上的方法即LIIC方法寻找光致异构的圆锥交叉点，我的理解是从反式基态优化结构作为起点，进行二面角扫描，以顺式基态结构优化角度作为二面角扫描的终点。然后在每一个点位进行垂直激发计算单点能绘制能量曲线，从而寻找能量相同的点。
这样理解对吗？恳请大佬多多指教，谢谢！！

作者
Author: wal 时间: 2026-3-28 12:42
感觉你的理解有误。我看原文的意思是先搜到CI，再用LIIC插值出轨迹算激发。你这是给人家反过来了，用扫描找CI。

作者
Author: xiaohuo 时间: 2026-3-28 13:19

wal 发表于 2026-3-28 12:42
感觉你的理解有误。我看原文的意思是先搜到CI，再用LIIC插值出轨迹算激发。你这是给人家反过来了，用扫描找 ...

首先，我们将从分子动力学的角度出发，使用线性内插内坐标（LIIC）方法构建PIC光化学异构化的弛豫路径。这将详细解释其光异构化过程。
我看论文里面再引言里面是这样子写的，我再去认真研读一下，谢谢你

作者
Author: wal 时间: 2026-3-28 13:31

xiaohuo 发表于 2026-3-28 13:19
首先，我们将从分子动力学的角度出发，使用线性内插内坐标（LIIC）方法构建PIC光化学异构化的弛豫路径。 ...

这不是说的很清楚吗，liic研究的是路径

作者
Author: xiaohuo 时间: 2026-3-28 13:40

wal 发表于 2026-3-28 13:31
这不是说的很清楚吗，liic研究的是路径

能请教一下如何采用LIIC方法获得几何构型？
谢谢你，我刚开始学，谢谢

作者
Author: wal 时间: 2026-3-28 13:46

xiaohuo 发表于 2026-3-28 13:40
能请教一下如何采用LIIC方法获得几何构型？
谢谢你，我刚开始学，谢谢

LIIC获得构型是需要你先计算出CI的，然后根据CI结构和基态结构进行LIIC插值，插值出的轨迹称为路径

作者
Author: gravitylead 时间: 2026-3-31 12:58
线性内插（LIIC）的思路如下：
1. 几何优化反应物和产物的构型
2. 对两个结构进行线性插值，得到多个中间结构。这一步需要自己写脚本实现。
3. 依次计算每一个中间结构的能量，如果要考虑激发态的话还需要算垂直激发
4. 统计计算结果，绘制能量曲线

如果你能够确定反应物和产物之间存在交叉点，那么使用线性内插大概率能够看到一个接近交叉点的结构，以这个结构为基础再进行交叉点优化会顺利很多。
另外，线性内插的操作比较麻烦，需要通过脚本产生中间结构，然后逐一生成单点计算文件计算，最后逐一统计计算结果。很多时候，刚性/柔性扫描可以更方便地实现相同的目的。

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