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标题: 势能面扫描图如何做的敞亮 [打印本页]

作者
Author: xujian 时间: 2017-5-17 17:00
标题: 势能面扫描图如何做的敞亮
请问怎么样能把势能面扫描图做的如下图所示这么敞亮，GaussView直接保存的图很模糊。求指导！
(, 下载次数 Times of downloads: 61)

作者
Author: youyno 时间: 2017-5-17 19:45
在高斯view打开后，打开result的scan，在势能面窗口右键保存数据，将两列变量和一列能量的数据复制到SigmaPlot就可以用Create Graph直接画出3D Mesh的势能面图

作者
Author: xujian 时间: 2017-5-17 19:49

youyno 发表于 2017-5-17 19:45
在高斯view打开后，打开result的scan，在势能面窗口右键保存数据，将两列变量和一列能量的数据复制到SigmaP ...

好的，谢谢

作者
Author: meatball1982 时间: 2017-8-4 16:01
本帖最后由 meatball1982 于 2017-8-4 17:21 编辑

youyno 发表于 2017-5-17 19:45
在高斯view打开后，打开result的scan，在势能面窗口右键保存数据，将两列变量和一列能量的数据复制到SigmaP ...

youyno
你好。
在扫一个变量时，你说的是可行的。
如果是扫两个变量。右键就没有保存数据的选项了。
请问你的gauss view是什么版本的，我的是5.08

更新：
别一个可能的解决方法，可以直接通过log文件提取。
“Summary of the potential surface scan:“

作者
Author: Graphite 时间: 2017-8-5 12:06
本帖最后由 Graphite 于 2017-8-5 12:07 编辑

1.将SCAN的结果从.log文件复制出来
(, 下载次数 Times of downloads: 71)
2.导入到origin等绘图程序中（如必要先把上面的多行数据保存成txt，再用绘图软件导入之）
(, 下载次数 Times of downloads: 58)
3.绘制-颜色映射的曲面图 (, 下载次数 Times of downloads: 51)

作者
Author: meatball1982 时间: 2017-8-5 15:59

Graphite 发表于 2017-8-5 12:06
1.将SCAN的结果从.log文件复制出来

2.导入到origin等绘图程序中（如必要先把上面的多行数据保存成txt， ...

谢谢Graphite。
学会了。

作者
Author: xujian 时间: 2017-9-14 16:36

youyno 发表于 2017-5-17 19:45
在高斯view打开后，打开result的scan，在势能面窗口右键保存数据，将两列变量和一列能量的数据复制到SigmaP ...

请问您有sigmaplot安装包吗，我上回下载的试用到期了，就不能用了，不知您是否可以提供一个sigmaplot的安装包

作者
Author: xujian 时间: 2017-9-14 16:39

Graphite 发表于 2017-8-5 12:06
1.将SCAN的结果从.log文件复制出来

2.导入到origin等绘图程序中（如必要先把上面的多行数据保存成txt， ...

请问，您这个映射图是用origin做的吗？

作者
Author: Graphite 时间: 2017-9-14 19:03

xujian 发表于 2017-9-14 16:39
请问，您这个映射图是用origin做的吗？

是的

作者
Author: xujian 时间: 2017-9-14 19:31

Graphite 发表于 2017-9-14 19:03
是的

请问在哪个工具栏啊？

作者
Author: Graphite 时间: 2017-9-14 21:18
本帖最后由 Graphite 于 2017-9-14 21:20 编辑

xujian 发表于 2017-9-14 19:31
请问在哪个工具栏啊？

我这是2017版,公社里有下载.选曲面图,下拉出现3D颜色映射曲面
(, 下载次数 Times of downloads: 56)

作者
Author: xujian 时间: 2017-9-14 21:23

Graphite 发表于 2017-9-14 21:18
我这是2017版,公社里有下载.选曲面图,下拉出现3D颜色映射曲面

好的，谢谢

作者
Author: lijiayisjtu 时间: 2018-3-2 13:47

Graphite 发表于 2017-8-5 12:06
1.将SCAN的结果从.log文件复制出来

2.导入到origin等绘图程序中（如必要先把上面的多行数据保存成txt， ...

您好，为什么我打开log文件后，定位的是结果是Summary of Optimized Potential Surface Scan 而非summary of the potential surface scan?

作者
Author: Graphite 时间: 2018-3-3 11:25

lijiayisjtu 发表于 2018-3-2 13:47
您好，为什么我打开log文件后，定位的是结果是Summary of Optimized Potential Surface Scan 而非summary ...

1.我没有强调过关键词是什么，你at错人了
2.这个帖子关注的是几何参数1-几何参数2-能量的关系，任务类型是SCAN

作者
Author: lijiayisjtu 时间: 2018-3-3 13:53

Graphite 发表于 2018-3-3 11:25
1.我没有强调过关键词是什么，你at错人了
2.这个帖子关注的是几何参数1-几何参数2-能量的关系，任务类型 ...

我的任务类型也是scan #p opt=modredundant 6-31+g(d) um062x,scan的是键长B 3 7 S 20 -0.100000，但早log文件中也并没有找到几何参数1-几何参数2-能量的关系，可能是我意思没表达清楚，麻烦了

作者
Author: Graphite 时间: 2018-3-5 05:15

lijiayisjtu 发表于 2018-3-3 13:53
我的任务类型也是scan #p opt=modredundant 6-31+g(d) um062x,scan的是键长B 3 7 S 20 -0.100000，但早lo ...

你做的是放松的势能面扫描（“软扫”），前面楼层提到的都是（固定其他几何参数的）势能面扫描（“硬扫”）。硬扫是势能面扫描n个点，软扫本质上是用脚本生成了n个opt任务。
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根据你的关键字，会得到键长vs能量的关系。gview似乎可以直接查看（很久没用了，抱歉）。
如果手动操作，那么只要两列数据，第一列是键长从初始值开始每次改变-0.1，第二列是每次的能量，然后用任何绘图软件处理即可。
另，cclib（https://cclib.github.io/index.html）可以自动化解析输出文件，无需额外操作。

作者
Author: ginlpein 时间: 2022-3-24 00:00

Graphite 发表于 2018-3-5 05:15
你做的是放松的势能面扫描（“软扫”），前面楼层提到的都是（固定其他几何参数的）势能面扫描（“硬扫” ...

按照推荐，我在仔细研究用户手册并实际尝试后，想就此纠正一下，截至1.7.1版本（2022年），cclib依旧不支持对柔性扫描结果的解析输出。
另外需要注意的是，强行采用cclib处理柔性扫描结果，并不会报错，但是会输出错误的数值。比如对49个点的柔性扫描解析，scanenergies命令同样会输出49个数值，但是这49个数值与真实各点能量毫无关系，反而会产生误导效果！

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