计算化学公社

标题: Windows系统下将cp2k输出的restart转化为cif文件 [打印本页]

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作者
Author: zeminFeng    时间: 6 day ago
标题: Windows系统下将cp2k输出的restart转化为cif文件
最近需要频繁的利用Multiwfn将restart文件转为cif文件，搜索论坛后发现仅有linux系统下进行转化的工具，如下链接。

Linux系统下将cp2k输出的restart转化为cif文件
http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 39588&fromuid=67231


个人计算化学功底比较差，不太习惯使用linux系统，因此利用AI编写了一份windows下的转化工具（rest2cif.bat），需要转化为其他格式则需要自行修改相应代码。
使用方法：将.restart文件放置在rest2cif.bat所在文件夹，双击rest2cif.bat即可自动将其批量转换为cif文件。

1. @echo off
   
2. setlocal enabledelayedexpansion
   
3. 
   
4. :: ==========================================
   
5. :: 自动获取管理员权限代码块
   
6. :: ==========================================
   
7. :check_Permissions
   
8.     echo Administrative permissions checking...
   
9.     net session >nul 2>&1
   
10.     if %errorLevel% == 0 (
    
11.         echo Success: Administrative permissions confirmed.
    
12.     ) else (
    
13.         echo Failure: Current permissions inadequate.
    
14.         echo Requesting administrative privileges...
    
15.         goto :UACPrompt
    
16.     )
    
17.     goto :start_script
    
18. 
    
19. :UACPrompt
    
20.     echo Set UAC = CreateObject^("Shell.Application"^) > "%temp%\getadmin.vbs"
    
21.     echo UAC.ShellExecute "cmd.exe", "/c ""%~s0"" %*", "", "runas", 1 >> "%temp%\getadmin.vbs"
    
22.     "%temp%\getadmin.vbs"
    
23.     del "%temp%\getadmin.vbs"
    
24.     exit /b
    
25. 
    
26. :start_script
    
27. cd /d "%~dp0"
    
28. 
    
29. :: 设置 Multiwfn 绝对路径，不要有中文符号
    
30. set "MWpath="E:\Multiwfn_3.8_dev\Multiwfn.exe""
    
31. 
    
32. :: 创建指令流
    
33. (
    
34.     echo.
    
35.     echo 100
    
36.     echo 2
    
37.     echo 33
    
38. :: 此处可做修改，33为.cif，1为.pdb，2为.xyz，5为.wfn，32为.mwfn
    
39.     echo.
    
40.     echo q
    
41.     echo q
    
42. ) > cmd.txt
    
43. 
    
44. echo ---------------------------------------
    
45. echo Starting Batch Conversion...
    
46. echo ---------------------------------------
    
47. 
    
48. for /f "delims=" %%f in ('dir /b *.restart 2^>nul') do (
    
49.     echo Processing: "%%f"
    
50.     !MWpath! "%%f" < cmd.txt >nul 2>nul
    
51.    
    
52.     if exist "%%~nf.cif" (
    
53.         echo [OK] Success: "%%~nf.cif"
    
54.     ) else (
    
55.         echo [FAILED] "%%f"
    
56.     )
    
57. )
    
58. 
    
59. if exist cmd.txt del cmd.txt
    
60. 
    
61. echo ---------------------------------------
    
62. echo Done.
    
63. pause

复制代码

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作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ    时间: 6 day ago
到底有什么后处理软件有对cif文件的刚需？cif文件里的什么信息是必要的，只是基本的盒子矢量长度夹角与原子分数坐标（不算难），还是也得包括像https://github.com/cp2k/cp2k/issues/177提到的对称性与等价位置信息（更复杂）？

最近开发者在考虑把含Lattice=""字段定义盒子信息的extended XYZ文件作为默认的轨迹输出格式，方便multiwfn, ovito, ase等识别，所以我来顺便问问。

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作者
Author: zeminFeng    时间: 6 day ago

Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2026-4-7 11:34
到底有什么后处理软件有对cif文件的刚需？cif文件里的什么信息是必要的，只是基本的盒子矢量长度夹角与原子 ...

我是初学者，对我来说到了这一步基本就是观看图像了，xyz\pdb\cif格式都没啥区别，只是习惯了看cif。

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作者
Author: Loading0760    时间: 6 day ago
Multiwfn支持读取restart，然后应该是100-2-33就可以转成cif了，还可以转成pdb/xyz，挺方便的。

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作者
Author: spinel    时间: 6 day ago
Multiwfn本身就有windows版本，直接可以转换

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作者
Author: zeminFeng    时间: 6 day ago

Loading0760 发表于 2026-4-7 14:00
Multiwfn支持读取restart，然后应该是100-2-33就可以转成cif了，还可以转成pdb/xyz，挺方便的。

用的就是Multiwfn

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作者
Author: zeminFeng    时间: 6 day ago

spinel 发表于 2026-4-7 14:32
Multiwfn本身就有windows版本，直接可以转换

嗯嗯

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作者
Author: 花非花    时间: 5 day ago
Multiwfn永远的神！这个转化我现在天天用，100-2-33，完成！

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