标题: 求助CP2K做AIMD研究高浓度水溶液体系的流程问题 [打印本页] 作者Author: 花非花 时间: 5 day ago 标题: 求助CP2K做AIMD研究高浓度水溶液体系的流程问题 各位大神，新手刚开始学习cp2k的AIMD的模拟，摸索了一段时间，想学习AIMD和实验测试的进行结合，目的是得到平衡后的溶剂化结果，最多需要扩散系数。我先MS搭建模拟的高浓度（3~20 mol/kg)的不同电解质（如LiNO3，NaNO3,KNO3）体系的盒子（由于密度相差很大，搭建的时候考虑实验的密度，盒子一般大于15个埃，原子数500左右），然后选择COMPASIII力场进行MD得到初始结构： 运用此结构可以直接到CP2K固定晶胞选择OPT优化，得到合理的结构：1。直接进行NVT系综的模拟吗？还是2：需要先用经典的NPT预平衡后再NVT计算? 谢谢！~
作者Author: sobereva 时间: 5 day ago
如果怀疑力场下MD得到的密度不合理，CP2K做NVT MD前显然得先经过NPT的MD
更多信息参考
谈谈做分子动力学模拟什么时候适合用NPT和NVT系综 http://sobereva.com/761（http://bbs.keinsci.com/thread-57835-1-1.html）作者Author: 花非花 时间: 5 day ago
谢谢SOB大神！您的帖子我拜读过了。我的研究方向和主要内容还是在实验，AIMD只是补充。这样我是不是偷懒一点，采取MS去做NPT稳定晶胞，然后去CP2K-固定晶胞OPT----低温预热 ------300K正式开跑NVT？谢谢！~！作者Author: sobereva 时间: 4 day ago