计算化学公社

标题: 量子化学在药物设计中有哪些应用 [打印本页]

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Author: remake 时间: 5 day ago
标题: 量子化学在药物设计中有哪些应用
这几天要在公司的技术交流会上进行一次题为”量子化学在药物设计中的应用“的汇报，但是感觉纯量子化学在药物设计中的应用不是很广泛吧？还是我的知识面比较窄？不知道该讲什么内容，想问问有没有大佬懂这方面的，或者对此有啥想法。

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Author: sobereva 时间: 4 day ago
很多药物设计中涉及到的描述符都是量子化学方法结合波函数分析得到的，Multiwfn就能输出一堆，参考
Multiwfn可以计算的分子描述符一览
http://sobereva.com/601（http://bbs.keinsci.com/thread-23729-1-1.html）

药物设计和分子动力学模拟有紧密关系，分子做模拟用的配体的原子电荷往往也是量子化学结合波函数分析方法获得的，参考
RESP拟合静电势电荷的原理以及在Multiwfn中的计算
http://sobereva.com/441（http://bbs.keinsci.com/thread-10880-1-1.html）
动力学模拟用的力场参数很多也靠量子化学计算得到，如扫描二面角并拟合扭转势曲线

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Author: student0618 时间: 4 day ago
本帖最后由 student0618 于 2026-4-9 02:13 编辑

很古老的QSAR 用到 CoMFA 方法就已经是用量化算电荷的。

现在是进化成用五花八门、更好的量化方法得到更好的描述符，再用很fancy的模型来fit data。名字可能不同，实际上都是这套路。

还有用量化方法看药物相关蛋白的机理 (很多，不详述了)、用FMO 算结合能 (GAMESS-US的人有几篇)

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Author: wbqdssl 时间: 4 day ago
也有一些用QM/MM方法研究酶催化机理的文章，如研究药物分解/稳定性（青霉素/头孢类和β-Lactamase的作用机制）。也许你可以检索下与酶催化相关的药物设计内容，此类情景多涉及量化内容。

作者
Author: remake 时间: 4 day ago

sobereva 发表于 2026-4-9 01:10
很多药物设计中涉及到的描述符都是量子化学方法结合波函数分析得到的，Multiwfn就能输出一堆，参考
Multiw ...

收到！谢谢卢老师

作者
Author: remake 时间: 4 day ago

wbqdssl 发表于 2026-4-9 07:19
也有一些用QM/MM方法研究酶催化机理的文章，如研究药物分解/稳定性（青霉素/头孢类和β-Lactamase的作用机 ...

谢谢，酶催化确实是较多用到，不过我所在的地方有专门的酶催化部门，我不太适合汇报这方面的内容

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Author: remake 时间: 4 day ago

student0618 发表于 2026-4-9 02:04
很古老的QSAR 用到 CoMFA 方法就已经是用量化算电荷的。

现在是进化成用五花八门、更好的量化方法得到更 ...

好的，谢谢大佬，FMO 算结合能之前没了解过，我去学习下

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Author: sobereva 时间: 3 day ago

remake 发表于 2026-4-9 16:36
好的，谢谢大佬，FMO 算结合能之前没了解过，我去学习下

FMO是通过分块方式，使得DFT等方法对大体系算能量耗时显著降低的方法。但涉及到蛋白质尺度的很大体系用半经验级别的量子化学方法如PM6-D3H4'+OH、GFN2-xTB算相互作用能精度也尚可，耗时比用FMO结合DFT还低得多得多

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