如果本文介绍的功能对你的研究起到了帮助，请记得发表文章时按照Multiwfn启动时的说明引用Multiwfn原文。 作者Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 3 day ago
非正交盒子的cube文件也可以这样操作是很好的，期待multiwfn实现主功能0显示非正交盒子的格点数据等值面的一天。
顺便提供一个VESTA可视化方案。虽然VESTA可以载入Gaussian型cube文件获得格点数据和原子坐标，但会分成两个体系 (phase) 储存，其中第一个含有带盒子信息的格点数据、第二个含有不带盒子信息的原子坐标，通过Edit - Edit Data窗口的Phase和Unit cell两个面板可以确认。所以要先转换一下文件格式再观察，具体操作为：
1. 将原胞格点数据和原子坐标的cube文件载入multiwfn，但是先用1000 - 18设置晶胞信息与盒子信息相同，记下以Bohr^3为单位的Cell volume数据（如对此文的cube文件是15667.5921 Bohr^3），然后用100 - 2 - 37 - [回车]导出原胞的CHGCAR文件（不需要像本文拿VMD显示的那样把文件做成超胞的），最后0 - q优雅退出；
2. 用VESTA载入CHGCAR文件；
3. 按http://bbs.keinsci.com/thread-57577-1-1.html的4楼所说，由于VESTA除了盒子内的原子外也会根据距离判断成键、进而增加一些显示原子以使得边界处的分子没有被截断，所以需在Edit - Bonds的窗口中一个个点下面识别的键的种类，右上角Boundary mode都切换为Do not search atoms beyond the boundary，就能取消周期镜像的原子的显示了；
4. 在Objects - Properties - Isosurfaces里设置等值面的显示，参考我在另一个帖的操作，注意由于VESTA手册说了When these files are read in to visualize isosurfaces and sections, data values are divided by V in the unit of bohr^3，所以打算显示0.001 a.u.的等值面时应当设置Isosurface level为0.001/15667.5921 = 6.3826e-8的值；
5. 最后，在Objects - Boundary适当设置Ranges of fractional coordinates即可。