计算化学公社

标题: Multiwfn计算福井函数和双描述符求助,图片中的原子数目和建立的模型不一致 [打印本页]

作者
Author:
kmu2401    时间: yesterday 11:57
标题: Multiwfn计算福井函数和双描述符求助,图片中的原子数目和建立的模型不一致
各位老师和同仁们,我在利用Multiwfn计算福井函数和双描述符(http://sobereva.com/484)时,遇到导出的福井函数图片中原子数目和建立的模型不一致,而导出的CDFT.txt中原子数目和结构优化后的一致,感觉很奇怪,不知道哪里出现了问题。请问这种情况正常吗?不正常的话该如何处理。具体问题如下:
结构优化后的模型:
(, 下载次数 Times of downloads: 2)
导出的CDFT:
(, 下载次数 Times of downloads: 1)

导出的福井函数图片:
(, 下载次数 Times of downloads: 3)
作者
Author:
sobereva    时间: yesterday 12:48
描述不具体、有严重歧义。第二张图根本不是Multiwfn直接绘制出来的,而是基于Multiwfn导出的cube文件用VMD绘制的
检查整个流程涉及的每个步骤、屏幕上的提示、载入的每个文件和导出的文件里的原子,自然知道哪步有问题、弄错了
作者
Author:
kmu2401    时间: yesterday 13:00
sobereva 发表于 2026-4-12 12:48
描述不具体、有严重歧义。第二张图根本不是Multiwfn直接绘制出来的,而是基于Multiwfn导出的cube文件用VMD ...

谢谢sobereva老师,我再重新试一试。
作者
Author:
kmu2401    时间: yesterday 17:52
本帖最后由 kmu2401 于 2026-4-12 17:57 编辑
kmu2401 发表于 2026-4-12 13:00
谢谢sobereva老师,我再重新试一试。

@sobereva 很抱歉sobereva老师,又来麻烦您了。我已经重新按照(http://sobereva.com/484)里的步骤试了好几次(具体步骤:“接下来计算福井函数和双描述符。在当前模块里选择3 Calculate grid data of Fukui function, dual descriptor and related functions,然后选择一个合适的格点设定,对于当前这样小体系选择Medium quality grid就够了(大体系应当用High quality grid或其它选项,详见http://sobereva.com/452中的Q39的讨论),然后程序会依次载入当前目录下的N.wfn、N+1.wfn和N-1.wfn并计算电子密度格点数据,之后会看到一个菜单。通过选择相应选项,可以把各种类型的福井函数以及双描述符直接显示成等值面图”),其中格点设置我选择的是High quality grid,得到的等值面图如下图所示:
(, 下载次数 Times of downloads: 4)
这和原来结构优化后的模型相比,感觉原子数目不完整。而通过(http://sobereva.com/484)里的步骤(在当前模块里选择2 Calculate various quantitative indices,然后程序就会依次载入wfn文件,读取其中的能量信息和波函数信息,自动计算Hirshfeld电荷,最后给出各种指数。对于6-31G*基组下的苯酚,在Intel 4核机子下不出10秒钟就都算完了。算完的数据被输出到了当前目录下的CDFT.txt中)得到的CDFT.txt文件里的原子数和结构优化后的且保持一致。再次希望sobereva老师,帮忙分析分析大概率是那个步骤出现问题,非常感谢您。
原来结构优化后的模型:
(, 下载次数 Times of downloads: 2)
CDFT文件:
(, 下载次数 Times of downloads: 1)

作者
Author:
sobereva    时间: 20 hour ago
kmu2401 发表于 2026-4-12 17:52
@sobereva 很抱歉sobereva老师,又来麻烦您了。我已经重新按照(http://sobereva.com/484)里的步骤试了 ...

检查Multiwfn刚启动后载入的文件,以及N.wfn、N-1.wfn、N+1.wfn,里面原子数都是多少。肯定文件有问题
Multiwfn启动后直接载入无论哪个文件,都会显示原子数和化学组成





欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3