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标题: 含Zn,Co金属的配合物在orca里用什么泛函和基组结构优化、计算gibbs自由能 [打印本页]

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李唯一    时间: 2026-4-15 21:25
标题: 含Zn,Co金属的配合物在orca里用什么泛函和基组结构优化、计算gibbs自由能
配合物结构如图,M为Zn,主要计算gibbs自由能

结构优化使用r2SCAN-3c,需不需要加D4色散校正
单点能计算使用PWPB95-D4/def2-TZVPP

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睡觉不打鼾    时间: 2026-4-16 09:40
请看:
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择 - 量子化学 (Quantum Chemistry) - 计算化学公社

• 过渡金属-配位键键长优化:
3d金属:适合纯泛函或低HF成份泛函。首选TPSS或TPSSh。r2SCAN也不错


壳层过渡金属-有机反应能和势垒(涉及到配位键的形成/断裂、多参考特征不很强的情况):首选wB97X-V或wB97M-V,其次PBE0-D3(BJ)和MN15。TPSSh-D3(BJ)也不赖。必须用纯泛函的话,用B97M-rV或差一点的B97M-D3(BJ),再其次是SCAN-D3(BJ)或TPSS-D3(BJ)。用r2SCAN-3c组合方法的话不仅便宜且精度大概率强于任何纯泛函+色散校正且结合大基组
壳层过渡金属-有机反应能和势垒(涉及到配位键的形成/断裂、多参考特征不很强的情况):首选TPSS0-D4,其次PBE0-D4(PBE0-D3(BJ)稍逊一丝)。纯泛函当中B97M-V表现最好,但用r2SCAN-3c组合方法的话不仅便宜且精度还强于B97M-V/def2-QZVPP

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李唯一    时间: 2026-4-16 10:14
睡觉不打鼾 发表于 2026-4-16 09:40
请看:
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择 - 量子化学 (Quantum Chemistry) - 计算化学公社

用赝势基组会不会更好
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sobereva    时间: 2026-4-16 15:13
r2SCAN-3c可以用,本身自带了色散校正。但比起更便宜的B97-3c在opt freq方面没明显优势,鉴于体系较大,还不如用B97-3c
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李唯一    时间: 2026-4-16 15:21
sobereva 发表于 2026-4-16 15:13
r2SCAN-3c可以用,本身自带了色散校正。但比起更便宜的B97-3c在opt freq方面没明显优势,鉴于体系较大,还 ...

谢谢社长
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睡觉不打鼾    时间: 2026-4-16 15:53
李唯一 发表于 2026-4-16 10:14
用赝势基组会不会更好


请看:
谈谈赝势基组的选用 - 量子化学 (Quantum Chemistry) - 计算化学公社

第四周期元素:用不用赝势基组皆可。一般我还是推荐用赝势基组,因为此时它带来的两条优点已经开始显现了,赝势基组可选择余地此时也多了。如果体系中只有很少量第四周期元素,比如配合物当中的过渡金属,并且想在写输入文件时省事或者希望所有元素用的基组都统一,那么都用全电子基组也完全可以。如果体系中有大量第四周期元素,比如计算较大的过渡金属团簇,那么强烈建议用赝势基组,耗时会节约甚巨。

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Uus/pMeC6H4-/キ    时间: 2026-4-16 16:46
这个键线式画得不太够规范,请注意考虑几点:
1. 整个配合物的净电荷是多少,两个钴都是什么氧化态,四个羧酸配体到底有没有未电离脱去的羧基氢;
2. 三个锌离子的四配位构型是平面四方还是四面体,或者还存在其他溶剂分子作为配体凑够八面体六配位构型;
3. 两个钴是否有类似http://sobereva.com/82提到的反铁磁耦合,导致配合物的净自旋多重度为1但表现为自旋极化开壳层单重态。




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