计算化学公社
标题:
用Gaussian做金属离子与萃取剂的频率加优化时用的计算级别求助
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作者Author:
极乐
时间:
13 hour ago
标题:
用Gaussian做金属离子与萃取剂的频率加优化时用的计算级别求助
1. 算什么体系,多少原子、都有什么元素
三元疏水性低共熔溶剂(HDES)萃取 Co2⁺、Ni2⁺、Mn2⁺ 的体系,三元体系一共大约130个原子,元素有C、H、O、P、Co / Ni / Mn
2. 算什么问题
三元HDES内部的相互作用方式,三元HDES与金属离子的相互作用
3. 要求多高精度、用什么理论方法
想用opt freq m06/def2-TZVP geom=connectivity机组,后处理相互作用能分析,HOMO-LUMO分析,IGMH分析
4. 能利用的计算资源如何(尤其是核数)、能接受最多多长的计算耗时
电脑一共16核,最长耗时三天
5. 用什么程序
Gaussian 16W:做 DFT 几何优化、频率,单点能计算,Multiwfn:做电荷、轨道、IGMH 等后处理分析,VMD辅助可视化相互作用区域,
用Gaussian计算单独萃取剂,三元HDES,三元HDES与过渡金属都用opt freq m06/def2-TZVP geom=connectivity这个机组可以吗?
作者Author:
wal
时间:
12 hour ago
这个资源这个级别,估计算不动的,你可以考虑优化降到2zeta基组如def2SVP,再用def2TZVP计算能量、进行波函数分析等
一些小问题:
1. 是基组,不是机组。基组是描述一个原子用的基函数,例如def2TZVP,6-31G*
2. def2-TZVP是基组的正确名称,但Gaussian认的关键词是def2TZVP
3. G16W计算效率低下,如有可能请使用Linux版,算的动的几率会大大增加
4. geom=connectivity没什么用,可以把这个关键词和坐标后面的键连关系全删掉,不影响计算且增加可读性
5. M06我不清楚算这个合不合适,这么大有机体系只有一个过渡金属的话我可能会选PBE0
作者Author:
sobereva
时间:
8 hour ago
注意恰当填写帖子标题,不要用“用Gaussian做金属离子与萃取剂的频率加优化时,opt freq m06/def2-TZVP geom=conne...” 这种残缺的意义不明的标题,看到帖子标题有问题时及时编辑修改。
这次我给你改了,以后注意
作者Author:
sobereva
时间:
8 hour ago
opt freq以及产生波函数文件用Multiwfn做分析:PBE0-D3(BJ),过渡金属用SDD,其它部分6-311G*。想再节约耗时可以对不重要的原子(配位键不涉及的)用6-31G*
单点时基组提升到def2-TZVP
注意阅读:
浅谈为什么优化和振动分析不需要用大基组
http://sobereva.com/387
(
http://bbs.keinsci.com/thread-6600-1-1.html
)
欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)
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