计算化学公社
标题:
关于MS绘制模型图的问题
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作者Author:
wanzongliang
时间:
2 hour ago
标题:
关于MS绘制模型图的问题
想请教sob老师和各位,如图a的模型图是如何绘制的,可否使用Multiwfn去做这种类型的图,如何去实现?
作者Author:
sobereva
时间:
2 hour ago
我推荐的做法:用GROMACS(速度甩M$好几条街还完全免费、流行度比M$高一个数量级以上)跑动力学之后,用VMD载入轨迹/gro文件,对疏水和亲水两类物质各创建一个representation,quicksurf方式显示,分别指定成蓝色和黄色。创建Representation用到的选择语句参考下文
VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504
(
http://bbs.keinsci.com/thread-14267-1-1.html
)
北京科音分子动力学与GROMACS培训班(
http://www.keinsci.com/KGMX
)里的一个这种类型图的例子(体系尺度远小于你的图里的,材质和颜色也没进一步调整,故效果有差异)
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