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标题: 报错:体系电荷带负电荷 [打印本页]

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微塑料    时间: 9 hour ago
标题: 报错:体系电荷带负电荷
输入这个命令之后:gmx grompp -f em.mdp -c solv.gro -p model.top -o em.tpr。出现报错: (, 下载次数 Times of downloads: 0) 。 报错告知我体系的带负电荷,如果继续计算可能会受负电荷影响导致计算结果不准确。体系是纯分子没有离子,正常是不会出现负电荷的。请问:出现负电荷的原因?如何修改?


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pal    时间: 6 hour ago
检查各个分子的itp,某个分子的总电荷不为0
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K1ro    时间: 5 hour ago
纯分子也会电荷总和不为0啊,比如氨基酸残基HIS就有可能带电,检查总电荷,excel算一下




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