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标题: 用gaussview修改双键后,未调整键长,对制作itp文件是否有影响 [打印本页]

作者
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2329568177    时间: 5 hour ago
标题: 用gaussview修改双键后,未调整键长,对制作itp文件是否有影响
老师,我在制作非标准氨基酸残基力场时有一个问题:在GaussView中修改双键后,若未同步调整键长,保存为PDB文件再重新打开,双键会变回单键。基于这种情况,后续为该结构制作非标准氨基酸残基力场时,生成的ITP文件是否会将双键误判为单键,从而导致力场参数错误?

作者
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student0618    时间: 4 hour ago
pdb没有保留成键资讯的。

已经有itp就检查 atomtype 及键是否对应正确参数。
用mol2的就检查mol2的原子类型和bond 对应原子部分。
作者
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2329568177    时间: 4 hour ago
student0618 发表于 2026-4-27 13:56
pdb没有保留成键资讯的。

已经有itp就检查 atomtype 及键是否对应正确参数。

谢谢老师





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