计算化学公社

标题: 请问能否不跑IRC直接用找到的过渡态对两端反应物和产物结构进行优化? [打印本页]

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Echo_KK    时间: 2026-4-29 12:05
标题: 请问能否不跑IRC直接用找到的过渡态对两端反应物和产物结构进行优化?
本帖最后由 Echo_KK 于 2026-4-29 12:04 编辑

大家好,我是有机合成方向的,最近入门DFT计算。
我想请问一下我已找到过渡态,从虚频振动来看是合理的。现需要对该过渡态两端反应物和产物结构优化,因为反应有过渡金属的两百多个原子,另外后续还要计算不同选择性的8个相似的过渡态,每一个都跑完整IRC预计耗时太长。
我的问题是:
1.能否不跑IRC而直接用该过渡态的虚频振动里面的manual displacement手动调到合适的反应物和产物位置导出两个结构进行优化?
2.manual displacement手动调整得到的结构和IRC两端的结构在后续计算能量上会有很大差别吗?
非常感谢各位大佬的解答!
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ArchieMiao    时间: 2026-4-30 09:35
很明显的不跑也可以,手动调节出两个结构进行优化。不够明显的还是去跑IRC。 因为是为了看趋势,因此IRC可以不跑那么多点,并调大步长为2倍默认步长,以节约时间。但是含过渡金属体系的优化调大步长可能会有不收敛的危险
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sobereva    时间: 2026-4-30 11:40
按照虚频微调结构后进行几何优化得到与之相连的极小点是很常规做法。但记得几何优化步长上限要改小点,免得跑飞了,优化到不是与这个过渡态直接相连的极小点去
跑IRC时用较大步长结合LQA,并且读取之前过渡态振动分析产生chk里的Hessian而避免用calcfc,整个IRC任务也贵不到哪去,你能优化得出来过渡态就不至于计算资源跑不出来IRC

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Echo_KK    时间: 2026-5-8 18:36
ArchieMiao 发表于 2026-4-30 09:35
很明显的不跑也可以,手动调节出两个结构进行优化。不够明显的还是去跑IRC。 因为是为了看趋势,因此IRC可 ...

感谢前辈指点,确实出现了默认步长下IRC不收敛的情况,步长减小一倍能跑出来了
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Echo_KK    时间: 2026-5-8 18:39
sobereva 发表于 2026-4-30 11:40
按照虚频微调结构后进行几何优化得到与之相连的极小点是很常规做法。但记得几何优化步长上限要改小点,免得 ...

感谢sobereva老师的指点,其实主要是为了想省点时间




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