计算化学公社
标题:
oniom计算S1激发态发射光谱求助
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作者Author:
iamjjLin
时间:
3 hour ago
标题:
oniom计算S1激发态发射光谱求助
各位老师,大家好!
我想计算薄膜中某个分子的S1激发态发射光谱,受到这篇帖子的启发(
oniom计算激发态及背景电荷求助 - 量子化学 (Quantum Chemistry) - 计算化学公社
),设计了以下的计算流程:
1、用packmol将单个发光分子和大量主体分子放进晶胞,使用GROMACS跑一段动力学达到平衡,以发光分子为中心抠出团簇。
2、对团簇使用oniom方法,优化中心分子的S1态结构。
3、使用oniom优化后的团簇,将周围分子都用拟合静电势电荷当成背景电荷,计算中心分子的S1态发射光谱。
请问各位老师,这个流程合理吗?有没有需要改进或注意的地方。谢谢!
作者Author:
cokie
时间:
2 hour ago
看你的描述,薄膜是非单一成分的,是所谓“主体分子”+“发光分子”的混合物旋涂。那么你需要考虑:
1. 如果发光分子和主体分子是按某摩尔比混合的,packmol构建体系时也需要按此摩尔比;
2. 如果发光分子是痕量参杂,那建议你可以考虑直接把客体分子,替换主体分子晶体中的其中一个分子,抠出团簇冻结边缘跑xtb即可,无需MD。
3. 采用方法2的前提,是纯主体分子的XRD与主体+客体参杂后的XRD无明显的区别(即晶相和晶胞参数不受影响)才可以。
4. 主客体体系通常存在分子间电子转移,你的步骤2、3会忽略掉电子转移发光的情况,如果你的实测光谱中有明显的、相比单客体发光多出的CT组分,建议补充一个客体+主体的二聚体参比并计算发光。
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