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标题: 如何通过CP2K获得吸附体系的最终结构和能量 [打印本页]

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cheng1    时间: 4 hour ago
标题: 如何通过CP2K获得吸附体系的最终结构和能量
本帖最后由 cheng1 于 2026-4-30 10:41 编辑

请教老师,我使用CP2K计算一对对映体(右图)在同一基底(左图)上吸附能对比。分别在a、b、c晶胞面上跑了AIMD(即a面上放置R对映体、a面上放S对映体、b面上放R对映体……,共6组),然后从各自轨迹中取10个特征点对吸附后的结构进行优化和能量计算:
Q1:每个轨迹中取特征点计算后得到10个能量值,只取各组最低能量及对应结构作为对应组最终结果是否合理?
Q2:三个面(a、b、c)上的吸附构型,如何判断取哪个或哪些结构作为最终的吸附结果?

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sobereva    时间: 3 hour ago
1 假定动力学过程中采样足够充分,这样做可以。但最理想的还是取自由能最低的结构,还可以讨论亚稳的吸附结构、根据Boltzmann公式讨论分布比例和温度的影响

2 可以每个晶面上能量最低吸附结构都进行报道,每个面的吸附结果都有各自意义
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cheng1    时间: halfhour ago
sobereva 发表于 2026-4-30 11:55
1 假定动力学过程中采样足够充分,这样做可以。但最理想的还是取自由能最低的结构,还可以讨论亚稳的吸附结 ...

感谢卢老师




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