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标题: 使用Gaussian进行结构优化但分子中二茂铁结构总是明显畸变的问题请教 [打印本页]

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Author: gmuCJH 时间: 2026-4-30 23:40
标题: 使用Gaussian进行结构优化但分子中二茂铁结构总是明显畸变的问题请教
本帖最后由 gmuCJH 于 2026-4-30 23:40 编辑

各位坛友大家好，我现在用Gaussian做一个含二茂铁结构的反应物分子的结构优化，我用gview进行分子结构建模，起始结构中二茂铁为夹心结构，但是计算结束后（normal结尾），二茂铁的夹心结构畸变很明显，并且得到的结构显示Fe还与五元环上的部分碳原子形成了共价键。我尝试在gview中将二茂铁的10个碳原子和1个Fe原子结构固定（不参与优化），优化的结构二茂铁部分是夹心结构，但是我觉得这种处理不符合计算的实际情况，但是，只要整个分子一起优化，二茂铁的结构就会变的很乱（如图所示，选中的原子为二茂铁的碳原子）。所以，在此请教一下大家，怎么在用gaussian进行结构优化的过程中保持二茂铁结构部分的合理性，谢谢！

说明：（1）提到的二茂铁畸变的输入文件2个gjf和计算输出文件2个log，均在附件压缩包Files文件夹中，即固定和没固定二茂铁的相关计算文件；（2）我用的DFT水平很烂，因为我只是想先看一下大概结构，然后再用高水平的进行计算。

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Author: UW_0728. 时间: 2026-5-1 10:48
尝试换个泛函，比如pbe1pbe？另外，你给Fe加了赝势基组却没有定义赝势，这应该是个硬伤

作者
Author: sobereva 时间: 2026-5-1 15:33
仔细看此文弄清楚怎么定义赝势。这是初学者最容易犯的经典问题之一
详解Gaussian中混合基组、自定义基组和赝势基组的输入
http://sobereva.com/60
若无特殊情况，优化收敛限没必要tight

作者
Author: gmuCJH 时间: 2026-5-1 21:37

UW_0728. 发表于 2026-5-1 10:48
尝试换个泛函，比如pbe1pbe？另外，你给Fe加了赝势基组却没有定义赝势，这应该是个硬伤

谢谢，我再确认一下赝势基组的问题。

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Author: gmuCJH 时间: 2026-5-1 21:37

sobereva 发表于 2026-5-1 15:33
仔细看此文弄清楚怎么定义赝势。这是初学者最容易犯的经典问题之一
详解Gaussian中混合基组、自定义基组和 ...

好的，谢谢卢老师。

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