计算化学公社

标题: 请大家帮我看看这个计算配置怎么样？谢谢各位大佬 [打印本页]

作者
Author: dazhuang001 时间: 2026-5-1 18:18
标题: 请大家帮我看看这个计算配置怎么样？谢谢各位大佬
CPU：       2*AMD EPYC 9654（单颗96核192线程，满载3.55 GHz）
主板：       技嘉MZ73-LM1
内存：       24*32GB=768GB 镁光/现代/三星DDR5-4800 ECC REG
GPU：       NVIDIA RTX 6000 Ada 48GB ECC
固态硬盘1：宏碁掠夺者 GM7 2TB（系统/程序/个人文件盘）
固态硬盘2：1 × 7.68TB 企业级 U.2 / U.3 NVMe Scratch 盘（临时文件盘）
电源：       先马XP1200
机箱：       追风者614PC + 3个普通14 cm机箱风扇
散热器：    2*金钱豹SP5 4U-M98 Pro 6热管（单塔双风扇）

请各位大佬帮我参考一下，谢谢（大部分的配置参考了http://sobereva.com/444）
目标是组建一个个人服务器，主要是用来跑高斯和VASP（一般原子数量在200-400个左右，DFT，TDDFT，激发态，过渡态），后续可能会用该机器跑图片类的表征数据。
预算10w以上，目前还没有去了解价格。想让各位大佬帮我瞅瞅看这个配置能否算得动目标体系

作者
Author: dodobird1 时间: 2026-5-2 07:47
有钱啊……光内存的价格可能得在6-7w吧

其实也可以少点内存过渡的，要不然现在太狠了一点
你的配置是顶配级别，至少对于Gaussian,如果算不动体系是体系太大了而不是配置差，感觉可能可以吧

作者
Author: sobereva 时间: 2026-5-2 08:18
在GPU使用场景尚不明确的情况，没必要花重金急着入NVIDIA RTX 6000 Ada 48GB ECC，倒不如再来一台双路9654

作者
Author: tonganlhy 时间: 2026-5-2 09:39
你这个配置跑高斯和vasp问题不大（如果跑不动就是体系太大了，个人服务器搞不定的），gpu倒是如Sob大大建议的不着急买，等有需要了再买。不然价格就奔着20W去了。

作者
Author: 睡觉不打鼾 时间: 2026-5-2 15:24
当然是非常夯（有钱真好）

作者
Author: dazhuang001 时间: 2026-5-2 20:59

dodobird1 发表于 2026-5-2 07:47
有钱啊……光内存的价格可能得在6-7w吧
其实也可以少点内存过渡的，要不然现在太狠了一点
你的配置是 ...

感谢大佬的建议

作者
Author: dazhuang001 时间: 2026-5-2 21:00

sobereva 发表于 2026-5-2 08:18
在GPU使用场景尚不明确的情况，没必要花重金急着入NVIDIA RTX 6000 Ada 48GB ECC，倒不如再来一台双路9654
...

嗯嗯好滴好滴，感谢大佬的建议。
还想请教一下大佬，这些配置在淘宝上寻觅就可以了嘛？

作者
Author: dazhuang001 时间: 2026-5-2 21:01

睡觉不打鼾发表于 2026-5-2 15:24
当然是非常夯（有钱真好）

感谢大佬的建议

作者
Author: 睡觉不打鼾 时间: 2026-5-2 21:51

dazhuang001 发表于 2026-5-2 21:00
嗯嗯好滴好滴，感谢大佬的建议。
还想请教一下大佬，这些配置在淘宝上寻觅就可以了嘛？

如果是走项目经费，可能还要看学校采购要求。自己掏钱（流动经费）的话淘宝就可以，不过需要店家提供详细的测试结果保证服务器稳定。

作者
Author: dazhuang001 时间: 2026-5-2 22:08

睡觉不打鼾发表于 2026-5-2 21:51
如果是走项目经费，可能还要看学校采购要求。自己掏钱（流动经费）的话淘宝就可以，不过需要店家提供详细 ...

好的，感谢大佬。店家提供详细的测试结果是指单个配件的嘛？我看淘宝上搜相关配件的时候，官方旗舰店都没有，搜出来的都是其他店铺（因为我对这个不了解）这种情况应该怎么搜索呢？感谢各位大佬

作者
Author: 睡觉不打鼾 时间: 2026-5-3 12:36
本帖最后由睡觉不打鼾于 2026-5-3 12:38 编辑

dazhuang001 发表于 2026-5-2 22:08
好的，感谢大佬。店家提供详细的测试结果是指单个配件的嘛？我看淘宝上搜相关配件的时候，官方旗舰店都没 ...

都是组装的，应该没有真正意义上的“品牌机”，即使所谓的DELL什么的，毕竟他们的机器也是各种零件拼起来的，比如cpu是AMD或Intel的，主板是超微或技嘉的，内存是三星或者镁光或者海力士的。

也没有“官方旗舰店”的概念，因为cpu和主板、内存厂商几乎没有toC的业务。从这个角度，无论是品牌机还是组装机都是BtoC。当然，你愿意花更多的钱去买DELL什么的“品牌机”机器也完全没有问题，也许（注意只是也许）它们的主板、cpu、内存都是全新的，但花超过三倍的价格买性能差异不到10%的配件不是那么地合理。淘宝的各种卖服务器的资质都是够的，只要避雷那种做一两单就跑路的店家，正常的都不会有问题。

至于测试结果，就是在工作条件下不死机、重启等硬件层面的问题，这个需要做一些调试比如限制cpu电压等。现在很多做服务器组装的店家对各种专业计算软件都会基本的测试，实在不会的你提供软件和算例也会乐意帮你测试好再发货。搜肯定是搜不到的，搜也没有用，每台机器都不完全一样。

要是课题组没有人懂一点点硬件，那就忍痛花超过30%的溢价给“品牌机”厂商购买全方位的售后服务吧。当然我相信如果这笔钱中的一小部分发给学生做劳务，能做的比大多数所谓售后好一百倍。

作者
Author: tonganlhy 时间: 2026-5-4 12:51

睡觉不打鼾发表于 2026-5-3 12:36
都是组装的，应该没有真正意义上的“品牌机”，即使所谓的DELL什么的，毕竟他们的机器也是各种零件拼起来 ...

只要溢价不是太离谱，整机买还是可以接受的。一个配件一个配件买的问题是真有问题扯起皮来非常耗时耗力。

作者
Author: 睡觉不打鼾 时间: 2026-5-4 16:01

tonganlhy 发表于 2026-5-4 12:51
只要溢价不是太离谱，整机买还是可以接受的。一个配件一个配件买的问题是真有问题扯起皮来非常耗时耗力。

一般也是整机的，挑好店家其实溢价可以接受，主要还是单位采购的问题，大宗固资手续巨麻烦

作者
Author: hjlyyc0999 时间: 2026-5-4 17:22
这个配置很赞啊，有米之人，问价之后来分享一下啊，也在想攒机，就是动作慢了，

作者
Author: dazhuang001 时间: 2026-5-6 08:35

睡觉不打鼾发表于 2026-5-3 12:36
都是组装的，应该没有真正意义上的“品牌机”，即使所谓的DELL什么的，毕竟他们的机器也是各种零件拼起来 ...

哦哦原来如此。感谢大佬的解释

作者
Author: dazhuang001 时间: 2026-5-6 08:35

tonganlhy 发表于 2026-5-4 12:51
只要溢价不是太离谱，整机买还是可以接受的。一个配件一个配件买的问题是真有问题扯起皮来非常耗时耗力。

是的，确实有这方面的担忧

作者
Author: dazhuang001 时间: 2026-5-7 12:50
各位大佬，这个价格和配置是OK的嘛？这个是别人公司给出的报价
请各位大佬帮我看看，感谢各位大佬

作者
Author: dazhuang001 时间: 2026-5-7 12:52
这个是一个供应商给出的报价，各位大佬能帮我看看这个配置和价格如何？
感谢各位大佬

作者
Author: tonganlhy 时间: 2026-5-7 13:46

dazhuang001 发表于 2026-5-7 12:52
这个是一个供应商给出的报价，各位大佬能帮我看看这个配置和价格如何？
感谢各位大佬

配置非常顶，但是显卡似乎没有必要，价格也算是比较高的，性价比一般。

作者
Author: dazhuang001 时间: 2026-5-7 13:49

tonganlhy 发表于 2026-5-7 13:46
配置非常顶，但是显卡似乎没有必要，价格也算是比较高的，性价比一般。

感谢大佬

作者
Author: David_R 时间: 2026-5-7 15:51
本帖最后由 David_R 于 2026-5-7 15:52 编辑

The RTX 5000 Pro Blackwell GPUs are very expensive, and, to ensure it's worth paying the premium for these cards, it's a good idea to double check that your workflows require the specifications they have over less expensive options. The main ones here are the two-slot cooler design (so they'll fit the GPU server form factor), the 72GB VRAM capacity, and ECC memory.

For many GPU-accelerated scientific computing applications, double precision is required, and this generation of workstation/professional class GPUs do not offer any huge advantages over the consumer class cards—you'll have to look at datacenter class GPUs for big improvements in performance here.

These days it's fairly straightforward to get modified consumer class cards with two-slot blower coolers, which offer great value for money when building GPU servers. I have quite a few of these in my cluster and have had good experiences with them, but I can understand why one might prefer to go the more official route.

The large VRAM capacities of these cards are really only useful for training or inferencing large ML models (like LLMs, at a scale much larger than is typically encountered for scientific applications), or MD simulations with a very large number of atoms. There are of course exceptions in this rapidly developing field, but I haven't come across any examples that exceed the typical VRAM capacities of consumer class cards (16-32 GB).

Also bear in mind that GPU parallelisation is also a challenging thing to get working properly, and I presume the two specified GPUs will be communicating via regular PCI-e (4.0?) connectivity, which can easily bottleneck some parallel code implementations. I wasn't entire sure what your immediate need for GPU acceleration was, but perhaps you could look at installing a single, inexpensive GPU first, test your workflows, and add more powerful accelerators later?

The other thing that I could foresee as a potential issue in this configuration is the relatively small capacity of fast storage. I couldn't tell whether these are regular SATA SSDs or M.2/U.2 NVMe drives, but in any case, I would want to configure more than 480GB of usable fast storage (especially as much of this will be taken by the OS) - in fact this is even less than the specified RAM capacity! Using the 16TB spinning HDD for continuous random read/writes in various workflows will be way too slow. I strongly recommend having a 4TB U.2 NVMe drive for scratch storage.

作者
Author: dazhuang001 时间: 2026-5-7 16:06
各位大佬，这个配置在这个价格是偏贵嘛？

作者
Author: dazhuang001 时间: 2026-5-7 16:13

David_R 发表于 2026-5-7 15:51
The RTX 5000 Pro Blackwell GPUs are very expensive, and, to ensure it's worth paying the premium for ...

嗯嗯好滴，感谢大佬

作者
Author: dodobird1 时间: 2026-5-16 17:36

dazhuang001 发表于 2026-5-7 16:06
各位大佬，这个配置在这个价格是偏贵嘛？

正如sobereva老师和David_R所说，如果GPU不需要不建议买，vasp主要要求的是双精度，这时候rtx 6000 ada好像还不如5090，要不然就用个消费级游戏显卡，要不然就计算卡（v100？a800？不是很熟悉）
硬盘也是系统盘可以4tb，然后数据盘可以是hdd，Gaussian最好应该单独分出来一个盘做临时文件，不过似乎可能dft影响不大？可以参考http://sobereva.com/397
如果不打算扔自己旁边的话显示器不用那么好，但是这么有钱区别也不大，零头中的零头
PSU电源最好明确一下品牌，虽然问题不大吧

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