计算化学公社

标题: ECD拟合地不好，并且与实测的对得不好 [打印本页]

作者
Author: unaya 时间: 3 hour ago
标题: ECD拟合地不好，并且与实测的对得不好
本帖最后由 unaya 于 2026-5-6 19:47 编辑

请教各位老师，我最近计算的一个化合物的ECD拟合地不好，图片和计算过程如下，请帮忙分析一下，万分感激！！！

(, 下载次数 Times of downloads: 0) (, 下载次数 Times of downloads: 0) (, 下载次数 Times of downloads: 0)
用ORCA计算ECD的R构型和S构型不是完全对称的，计算和实测的也对的不是很好。
怀疑用SPARTON构象搜索出来的全部构象(R有2个，S有2个)太少，
尝试用molclus搜索构象，只搜索出1个构象（R构型）。
之前用过高斯计算过ECD,对的也不好。
我现在需要换个搜索构象的软件搜索吗? 还是自己画几对？

作者
Author: wal 时间: 3 hour ago
本帖最后由 wal 于 2026-5-6 19:57 编辑

你这个图上每个线是啥好像没讲清楚

作者
Author: unaya 时间: 3 hour ago

wal 发表于 2026-5-6 19:52
你这个图上每个线是啥好像没讲清楚

哦谢谢提醒。虚线是计算的，实线是实测的

作者
Author: wal 时间: 3 hour ago

unaya 发表于 2026-5-6 19:53
哦谢谢提醒。虚线是计算的，实线是实测的

我仔细看了一下，你这个东西哪里有RS的手性。。？我只看到那个氮可能有轴手性，轴手性是这么标记的吗

作者
Author: unaya 时间: 3 hour ago

wal 发表于 2026-5-6 19:58
我仔细看了一下，你这个东西哪里有RS的手性。。？我只看到那个氮可能有轴手性，轴手性是这么标记的吗

这个化合物有轴手性。结构上忘记标记啦

作者
Author: wal 时间: 3 hour ago

unaya 发表于 2026-5-6 20:01
这个化合物有轴手性。结构上忘记标记啦

看着感觉对的还行，峰形是相似的，就是波长有点误差

作者
Author: unaya 时间: 3 hour ago

wal 发表于 2026-5-6 20:07
看着感觉对的还行，峰形是相似的，就是波长有点误差

对呀我这个图粗看很乱，细看又有相似的，现在不知道怎么搞了

作者
Author: 蛟龙翼微躬 时间: 2 hour ago
我觉得你构象搜索没考虑全，应该还需要考虑N翻转。你算的R/S的ECD不一样可能就是没考虑到N翻转这回事，导致你算得这两个构型不是对映异构体。你这ECD还是和实验光谱差得有点多，我建议考虑一下构象平均。

作者
Author: unaya 时间: 23 min ago

蛟龙翼微躬发表于 2026-5-6 21:32
我觉得你构象搜索没考虑全，应该还需要考虑N翻转。你算的R/S的ECD不一样可能就是没考虑到N翻转这回事，导致 ...

多谢老师指点！我试试氮翻转

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)