我的分子具有300个原子,我尝试过简单五螺烯和简单六螺烯在PM6级别下做柔性扫描扫二面角,可以得到较好的初猜过渡态没然后进一步用pm6优化,再使用B3LYP/6-31G(d,p)优化过渡态,优化结果也是很好的,irc也跑的很成功(学习了论坛其他相关帖子),但是在面对这样原子很多的体系,pm6柔性扫描先粗扫了一次(步数15,步长5.0),又细扫了一次(步数8,步长2.5),选取了能量最高的点在pm6下优化,体系很快就滑回了柔性扫描前的结构,应该怎末办呢,能不能先冻结其他两个螺烯环,因为过渡态只有一个螺烯发生翻转;或者在过渡态优化的时候可以加上D3色散校正 (, 下载次数 Times of downloads: 1)
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作者Author: 阮文升-河内国大 时间: 2 hour ago
错别字有点多,写得也有点乱,当前问题跟 B3LYP 究竟是什么关系?没看明白