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标题: AF3预测的多肽的活性变化不大甚至下降 [打印本页]

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Author: 夜航星 时间: 4 hour ago
标题: AF3预测的多肽的活性变化不大甚至下降
论坛的各位大佬好，我的研究是探索抗菌肽NZ2114的新靶点，我目前找到了其新靶点MraY，但是使用AF3针对这个靶点和已知靶点的定向突变得到的多肽的活性差别不大甚至有的相比于已经成熟的NZ2114有所下降该如何是好？这是否意味着我的那个新靶点并不靠谱？这条技术路线也走不通？

作者
Author: 夜航星 时间: 3 hour ago
现在就是关于新的抗菌肽的研究已经几乎停滞了，导师说产量和活性都没有很大的提升，已经基本宣告失败了，但是我导师设计的肽因为iptm下降比较多，在大量表达的情况下活性依然不好，同时我对这个肽的结构修改较大的那个去掉二硫键变异肽的MIC也变化不大，和iptm值相吻合，而不是像她们说的那样失去活性。就很纠结后面该怎么办，有没有对AF3的干湿实验比较了解的大佬解答一下我这种情况是否算是正常，实验是否依然有希望继续下去或者有哪些新的路线可以走？

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