计算化学公社

标题: 求助:如何将多帧.1og保存为一个PDB文件 [打印本页]

作者
Author:
2329568177    时间: 4 day ago
标题: 求助:如何将多帧.1og保存为一个PDB文件
我想用GMX计算MM曲线,如何才能将扫描的log保存为一个PDB文件,以及Gaussian如何从0°开始扫描


作者
Author:
dodobird1    时间: 4 day ago
openbabel应该可以;gaussview也可以直接save as另存为pdb

不过gaussian和gmx做计算的尺度差别很大 这是处于什么原因要这么进行?
作者
Author:
2329568177    时间: 4 day ago
dodobird1 发表于 2026-5-17 20:21
openbabel应该可以;gaussview也可以直接save as另存为pdb

不过gaussian和gmx做计算的尺度差别很大 这是 ...

我是想做rtp中的二面角参数,我看都是用Gaussian做QM,用gmx做MM,再拟合
作者
Author:
dodobird1    时间: 3 day ago
2329568177 发表于 2026-5-17 21:34
我是想做rtp中的二面角参数,我看都是用Gaussian做QM,用gmx做MM,再拟合

哦哦 qm/mm确实不了解 太强了




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3