标题: 无限延伸平面结构的模型构建和力场参数设置疑问 [打印本页] 作者Author: downpuor 时间: 4 day ago 标题: 无限延伸平面结构的模型构建和力场参数设置疑问 各位老师我主要想请问下对于石墨烯或者氧化石墨烯这样无限延伸的结构在分子动力学模拟中是怎么表现呢？是通过1.构建有限的结构同时加氢饱和边缘，或者2.将对应的最左端和右端，以及最上端和下端C相连，同时跨越盒子来表现吗？还是有别的合理方法？另外我想研究气体透过石墨烯/IL膜的表现，是否应该3.将石墨烯固定同时将IL固定在石墨烯层间内区域呢？作者Author: sobereva 时间: 3 day ago
当周期性体系模拟，存在跨盒子的键。参考http://sobereva.com/soft/Sobtop里创建周期性体系拓扑文件的例子和讨论
石墨烯/IL膜 指代不明，不要在未加限定时用IL这种不明确的缩写（虽然可能是指离子液体）。如果离子液体夹在两层石墨烯之间，没必要非得做什么固定，离子液体本身也跑不出去。 作者Author: downpuor 时间: 3 day ago