计算化学公社
标题:
CP2K的AIMD复杂体系该如何建模以及取样?
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作者Author:
northern_mar
时间:
3 hour ago
标题:
CP2K的AIMD复杂体系该如何建模以及取样?
本帖最后由 northern_mar 于 2026-5-27 15:11 编辑
各位老师好!
我近期想做一个比较复杂的AIMD反应,其中包含以下几个反应:
1)·OH与CH4反应生成·CH3+H2O
2)·O2-与CH4反应生成·CH3+·OOH
3)·[SO3]2-与·OH反应,保护·CH3,防止过氧化
请问我该如何构建我的模型?直接添加多个OH、O2、SO3、CH4,然后设置自旋多重度和电荷量可以吗?那这样子我该如何知道我需要的是多少帧的数据呢(目前只会导出轨迹一步一步看)?还是需要针对每个反应设置一个模型单独跑AIMD呢?
这个是直接设置多个反应的文章,直接加了10个H2O,10个CH4,10个O2(图片截取自此文章):
https://doi.org/10.1016/j.apsusc.2025.165310
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