计算化学公社

标题: 集成了结构编辑渲染的终端工作台 [打印本页]

作者
Author: 陪锂到天边 时间: 3 hour ago
标题: 集成了结构编辑渲染的终端工作台
做计算催化和计算材料的人，大概都熟悉这套流程：建模一个软件，写输入卡一个编辑器，scp 上集群，sbatch，扒 OUTCAR 看收没收敛，拉回来再换个工具画 DOS / 能带 / 自由能图。工具之间没有连接，半天耗在"搬文件"和"对格式"上。

我们在做的 CatGO 想换一种方式：把这条链收进一个 AI agent 驱动的桌面工作台。开源（AGPL-3.0），

另外，我们也集成了结构的渲染，并可以对渲染结构的bond和atom进行删减和修改。电荷密度文件和cube文件的渲染也支持，且可以对选择的三个原子进行切面，查看电荷密度。

仓库 https://github.com/Hello-QM/catgo-LRG ，欢迎大家点星！

网页版可直接打开试用 https://app.catgo-ucsd.org 。它现在真实能做的： 1. AI agent 是主交互，不是侧边栏摆设。 你用自然语言说要算什么，agent 从 OPTIMADE / PubChem 取结构、编辑结构、生成 slab / 吸附位 / 纳米管 / moiré / 异质结、生成 VASP·QE·LAMMPS 输入、编排可视化 DAG 工作流。两种用法：内置 CatBot 直接操作；或者你习惯的外部 agent——Claude Code / OpenAI Codex / Gemini——经 CatGO 提供的 MCP server + 5 个 skill 包接入驱动。

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直接和CatBot对话就能得到你想要的结构

2. 工作流引擎是真的会跑。 原生执行 VASP / CP2K / ORCA（DFT）、LAMMPS（MD）、ML 势（MACE/CHGNet/M3GNet）、xTB。催化场景内置 OER / NRR / CO2RR 路径、volcano plot、自由能 / 能量图等节点。也可以和本地的claude code, codex, gemini对话直接生成工作流，并将作业投递到远程服务器（进行实时监控）。

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拖拽节点就能生成工作流，且能在节点内编辑结构，添加吸附物。工作流也支持通过AI Agent 生成。亦可用AI Agent 帮你自定义节点。

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一键导出不同软件的输入文件

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在CatGo一键渲染分子和材料结构

支持多种分析方法，支持在本地力场进行结构优化，支持圆形裁剪，显示电荷，导出结构。

支持多种分析方法

鼠标右键功能

支持用XTB/MLP对结构进行优化，并实时查看优化过程。

可视化参数均可调，

开启性能模式之后支持对多帧千万+原子轨迹进行可视化，可导出mp4

添加图片注释，不超过 140 字（可选）

3. 自带终端 + SSH，直接连超算。 真 PTY 终端（xterm.js），SSH 支持 OTP / 跳板机 / SOCKS5；agent 连 HPC 投 SLURM / PBS 任务，投递、监控、看 log、看收敛，不用自己开终端敲 scp/sbatch。按住Ctrl + 点击文件，就能直接可视化和编辑远程的结构，要多方便有多方便。

左边看结构，右边连终端，干活建模两不误。

4. 结构与轨迹。3D 编辑器（铅笔模式增删原子、slab cutter），MD/NEB/IRC 轨迹回放，构建异质结，构建摩尔晶格，构建nanotube,。；导入 OPTIMADE/PubChem/拖拽，导出 POSCAR/CIF/XYZ/extxyz/mol2/PDB。出图 DOS/PDOS/能带/COHP（Plotly，可直接操作DOS/COHP，调到你满意为止）。

在CatGo进行切面操作

5. 手势 + 语音控制。 摄像头手势（MediaPipe 手部追踪，张掌旋转、捏合缩放、指点选原子）+ 中英双语语音命令 + TTS 反馈，离线模式带 Silero VAD + 本地 Whisper。已在 v1.1.0 发布。

手动+语言控制结构

降门槛这件事： 真实降门槛的是一键 Quick-Build 配方（零 LLM）+ agent 用自然语言把输入卡配好 + GUI 搭结构，对刚从实验转过来、不熟 INCAR 的人确实友好一些。关于来历： 结构 viewer / 周期表 / UI 核心衍生自 Janosh Riebesell 的 MatterViz，遵循 AGPL，特此致谢。我们想要两种人： - 一起写代码的——会 vibe coding 就行，不限技术栈（实际栈 Svelte 5 / Rust-Tauri / Python FastAPI），能跟 AI 把功能撸出来即可。- 提意见的——你算催化 / 材料 / 做相关实验时最想骂的痛点，就是我们最想要的需求。提 issue 就是贡献。评论区聊。

CatGo主界面

作者
Author: wangyj 时间: 2 hour ago
本帖最后由 wangyj 于 2026-5-27 15:55 编辑

好物，我去试一下

作者
Author: SakuraXiaoMa 时间: 2 hour ago
关注了很久了，终于遇到这种自动工作流的了

再过段时间感觉都不用自己干活了

作者
Author: student0618 时间: 2 hour ago
本帖最后由 student0618 于 2026-5-27 16:18 编辑

测试网页版 ai chat 报错

体系是预设的水
用英文版网页
网络不是大陆地区，但也是Claude限制的，没用上网工具，不知有没有影响。

Steps to reproduce

按下了“what is this structure”
显示 Claude code processing 几秒后报错 agent stream failed

作者
Author: 陪锂到天边 时间: 2 hour ago

student0618 发表于 2026-5-27 16:16
测试网页版 ai chat 报错

体系是预设的水

网页版的只能用API, 不支持CLAUDE CODE

作者
Author: student0618 时间: 2 hour ago
本帖最后由 student0618 于 2026-5-27 16:23 编辑

陪锂到天边发表于 2026-5-27 16:20
网页版的只能用API, 不支持CLAUDE CODE

是直接按ai chat的选项就报错，报错前出现claude code字样，抱歉没描述清楚

作者
Author: 陪锂到天边 时间: 2 hour ago

student0618 发表于 2026-5-27 16:22
是直接按ai chat的选项就报错，报错前出现claude code字样，抱歉没描述清楚

我刚刚测试了没有问题

作者
Author: student0618 时间: 1 hour ago

陪锂到天边发表于 2026-5-27 16:28
我刚刚测试了没有问题

或许是我手机网页版的问题，我换机器试试。谢谢！

作者
Author: exity 时间: 1 hour ago
要大AI管这个类似agent的东西，是不是能自动做计算，自动写论文？

作者
Author: 陪锂到天边 时间: 1 hour ago

exity 发表于 2026-5-27 17:09
要大AI管这个类似agent的东西，是不是能自动做计算，自动写论文？

本地版基本上做到了，欢迎体验

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)