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标题: 求助:关于使用CP2K配合Multiwfn和Sobtop生成非标准氨基酸力场参数的疑问 [打印本页]

作者
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Leafia    时间: 4 hour ago
标题: 求助:关于使用CP2K配合Multiwfn和Sobtop生成非标准氨基酸力场参数的疑问
各位老师们好, 最近我正在尝试为GROMACS生成非标准氨基酸残基的拓扑文件,参考了Sobtop官方FAQ5 (http://sobereva.com/soft/Sobtop/#download)的流程,我打算使用CP2K完成前期的量子化学计算。但在实操中遇到了一些细节疑惑,特来请教:
1. cp2k是否可以完全代替Gaussian和ORCA进行几何优化和振动分析呢,因为我看到http://sobereva.com/651这里Sobereva老师有提到可以用cp2k的 .molden文件进行处理后输入进Multiwfn?
2. 我已经使用CP2K进行了几何优化和振动分析,但在振动分析中开启.Molden 输出后,得到了很多文件。请问用于拟合RESP电荷的波函数,我该选择用哪个文件呢?我是否应该在几何优化完成后,单独拿优化好的最优坐标,跑一次 RUN_TYPE=ENERGY 的单点计算,来提取唯一正确的.Molden 输入给Multiwfn?

感谢各位前辈百忙之中答疑!


作者
Author:
牧生    时间: 3 hour ago

http://sobereva.com/soft/Sobtop/#download  中说的很清楚,用量子化学程序来计算。
(, 下载次数 Times of downloads: 0)
常用的CP2K是第一性原理程序,Gaussian和ORCA是量子化学程序。





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