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标题: 求助有无FSI阴离子的OPLS-AA/M力场和电荷参数 [打印本页]

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Author: GHR1111 时间: 7 hour ago
标题: 求助有无FSI阴离子的OPLS-AA/M力场和电荷参数
本帖最后由 GHR1111 于 2026-6-2 15:11 编辑

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作者
Author: student0618 时间: 7 hour ago
在网上求助计算化学问题时的注意事项
http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 7&fromuid=64740
(出处: 计算化学公社)

求助至少给个全写吧。

作者
Author: GHR1111 时间: 7 hour ago

student0618 发表于 2026-6-2 15:06
在网上求助计算化学问题时的注意事项
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=57&fromuid=6 ...

已改正

作者
Author: sobereva 时间: 6 hour ago
必须给出FSI的全称。假定这是一个有机分子或离子：

如果google搜不到专用的，就用ligpargen（看下文）以标准方式产生
几种生成有机分子GROMACS拓扑文件的工具
http://sobereva.com/266（http://bbs.keinsci.com/thread-428-1-1.html）如果是中性分子并且在水中模拟，建议结合Multiwfn算的1.2*CM5电荷，看
计算适用于OPLS-AA力场做模拟的1.2*CM5原子电荷的懒人脚本
http://sobereva.com/585（http://bbs.keinsci.com/thread-21462-1-1.html）

如果不是死活非得用OPLS-AA不可的话，强烈推荐sobtop（http://sobereva.com/soft/Sobtop）产生基于GAFF或GAFF2的拓扑文件，结合RESP2(0.5)原子电荷，见：
RESP2原子电荷的思想以及在Multiwfn中的计算
http://sobereva.com/531（http://bbs.keinsci.com/thread-16190-1-1.html）
ORCA结合Multiwfn计算RESP、RESP2和1.2*CM5原子电荷的懒人脚本
http://sobereva.com/637（http://bbs.keinsci.com/thread-28178-1-1.html）

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