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标题: 糖类分子构象变化大导致体系崩溃 [打印本页]

作者
Author: Infaltion 时间: 2026-6-10 09:53
标题: 糖类分子构象变化大导致体系崩溃
各位老师好，我近期在进行糖类分子动力学模拟，使用GAFF力场，文件都是通过Gaussian结构优化与频率分析后，经由Sobtop生成，但好像模拟后会报错说键的旋转超过了30度，体系崩溃，不知各位老师是否有办法解决

作者
Author: sobereva 时间: 2026-6-10 10:48
又是明显不该用Hessian算力常数的情况的时候乱让sobtop用Hessian算力常数。先把sobtop主页内容完整看一遍再用sobtop，尤其是认真看http://sobereva.com/soft/Sobtop#FAQ11
若用GAFF力场成键相关参数后还有问题，照着http://sobereva.com/soft/Sobtop#FAQ8排查

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