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标题: VMD软件中导入xyz轨迹文件后，手动输入晶胞盒子参数，盒子错位如何解决 [打印本页]

作者
Author: shuxinyu12 时间: 2026-6-10 11:27
标题: VMD软件中导入xyz轨迹文件后，手动输入晶胞盒子参数，盒子错位如何解决
本帖最后由 shuxinyu12 于 2026-6-10 11:27 编辑

在MS中提取了XYZ轨迹文件，导入VMD后，没有盒子参数，所以去MS软件中查看晶胞参数，然后TK命令设置，然后就是错位了，我想把盒子调整到像MS显示的那样（两者是中心位置重合的，但是还应该有一些原子在外面），然后再把外面的原子wrap进盒子，请问该如何操作使盒子和原子中心位置重合？

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作者
Author: sobereva 时间: 2026-6-10 12:33
直接wrap进盒子，看原子位置是否正常，正常就没事

作者
Author: shuxinyu12 时间: 2026-6-10 15:05

sobereva 发表于 2026-6-10 12:33
直接wrap进盒子，看原子位置是否正常，正常就没事

好像不行，我看wrap完下面的几层金属原子，中间出现了大的空隙 (, 下载次数 Times of downloads: 11)

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