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标题: 请问270kplus+5080的个人电脑配置用于MS,Lammps,Gaussian怎么样? [打印本页]

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我说你慢了!    时间: 2026-6-10 15:21
标题: 请问270kplus+5080的个人电脑配置用于MS,Lammps,Gaussian怎么样?
本帖最后由 我说你慢了! 于 2026-6-10 15:22 编辑

实验室准备配一台个人电脑用于分子模拟,常用MS,Lammps和Gaussian,具体配置如下图,请大家帮忙看看是否合适,我对电脑配置也是最近才开始学习,所以希望各位老师能给一些建议。另外,目前课题组内已经有一台工作站,详情配置部分参考http://sobereva.com/444中的较好双路服务器推荐配置。因为我已经试过MS用GPU加速的效率很高,所以这也是我想配置好一些的显卡的主要目的。我的问题主要如下:①图片中的CPU及配置适合用于跑Lammps和Gaussian吗?能不能满足计算需求。②硬盘我准备先用2T,有必要再加“希捷 银河企业级 8TB 256MB 7200rpm SATA3 (ST8000NM017B)”吗?或者硬盘直接换成“希捷 银河企业级 8TB 256MB 7200rpm SATA3 (ST8000NM017B)”?③现在ddr5的内存条价格太贵,16G*2差不多才够用,但我看到说cpu核数和内存建议1:4(270K的核数为24,按照比例即内存为96),是否有必要增加内存数量,综合现在价格居高不下,如果需要加内存,建议加到多少比较合适?另外内存的频率有必要上高频吗,6000的是不是就能够满足要求?
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rugals    时间: 2026-6-10 15:38
就32G内存,打游戏都嫌少
硬盘加到8T也是白加

当前的配置跑MD没什么问题,但是效率和性价比可能不如444博文推荐的配置。
跑gaussian跟笔记本一个水平
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sobereva    时间: 2026-6-10 17:27
跑量化,这么多核内存至少2*32GB

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我说你慢了!    时间: 2026-6-10 18:51
sobereva 发表于 2026-6-10 17:27
跑量化,这么多核内存至少2*32GB

谢谢老师答复。除此之外还想问老师,①是否这种配置相对不适合跑Lammps和Gaussian,主要是核数太少?②对于硬盘问题,您觉得我只用2T是否合适?③内存频率是否相对来说已经够用了,淘宝ddr5的6000频率的确实占了大多数,非必要我还是想省点钱。
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我说你慢了!    时间: 2026-6-10 18:54
rugals 发表于 2026-6-10 15:38
就32G内存,打游戏都嫌少
硬盘加到8T也是白加

谢谢答复。我准备加到32G*2,毕竟内存太贵先过渡一下,您说的在这种配置下硬盘加到8T也没啥好的效果是不是还是因为内存太小的问题,模型跑得很慢效率不高?
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dodobird1    时间: 2026-6-10 20:18
我说你慢了! 发表于 2026-6-10 18:51
谢谢老师答复。除此之外还想问老师,①是否这种配置相对不适合跑Lammps和Gaussian,主要是核数太少?②对 ...

这些软件都是比较吃CPU, Gaussian就是纯CPU任务,5080起不到作用,LAMMPS我用的不多 和gmx优化也有所不同,不是很了解。
理论上,这个配置是可以接受,但是确实核心数量少 多核性能弱一些,跑量化的板u可能不如买AMD的9950x 7950x+b6(8)50m(看看价格了,这个主板是不是不便宜)

硬盘跑量化的话先2t也行,也可以分两个1t,sob老师在你引用那片博文至少之前提到过两个硬盘 一个来读写临时文件

内存不加不行,没办法;这个CPU不清楚听说intel新系列打游戏需要频率高,做计算不清楚了 6000理论上是够的
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我说你慢了!    时间: 2026-6-10 23:09
本帖最后由 我说你慢了! 于 2026-6-10 23:37 编辑
dodobird1 发表于 2026-6-10 20:18
这些软件都是比较吃CPU, Gaussian就是纯CPU任务,5080起不到作用,LAMMPS我用的不多 和gmx优化也有所不同 ...

270kPlus是一款新U,24核24线程(附上站内一个测评贴如下图,链接为几颗不同处理器跑同一任务耗时比较 - 硬件配置与采购 (Hardware Configuration and Procurement) - 计算化学公社),也是主打生产力的U,好像是因为他家的某颗U缩缸的原因新推出的。目前270k性能(单核2405,多核43083)略高于9950X(单核2243,多核42743),但整体上差不多吧,我刚才搜了一下两个的价格(京东为例),前者2250,后者2850,差了600。

我刚才一直翻之前的配置帖子,包括444链接中社长在极高性能分子动力学服务器推荐配置中也是推荐9950X(16核32线程)。

主要原因是不是在分子模拟中更看重线程的数量,而不是核数,还请老师解释一下,谢谢啦
(, 下载次数 Times of downloads: 7)


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sobereva    时间: 2026-6-11 06:41
我说你慢了! 发表于 2026-6-10 18:51
谢谢老师答复。除此之外还想问老师,①是否这种配置相对不适合跑Lammps和Gaussian,主要是核数太少?②对 ...

1 可以跑lammps
可以跑Gaussian,但算大体系比双路7R32这样高性价比主流双路服务器配置慢得多

2 下文里我明确说了观点
计算化学购机配置推荐
http://sobereva.com/444

3 够
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dodobird1    时间: 2026-6-11 15:55
我说你慢了! 发表于 2026-6-10 23:09
270kPlus是一款新U,24核24线程(附上站内一个测评贴如下图,链接为几颗不同处理器跑同一任务耗时比较 -  ...

首先,价格上要比较要比较板U的价格,英特尔新系列的主板应该蛮贵的,主办之间的差价没准也能达到接近600快钱了;其次,下面的评测还是9950x更优一些,开了PBO2那个更是明显优秀;而且你要注意到你的评测里面的270kp用的是8000mhz的内存,如果你现在买不到效果可能还得打折扣?
英特尔的CPU一直有Performance和Efficiency core,也就是常说的大小核,p核心一个核心两个线程,e核心只有一个线程,e核心几乎也就只能当半个核心来算。所以说可以认为更看重线程的数量而非核数(因为AMD全是大核,一个核心可能可以顶两个e但是也就约等于一个p),两个CPU都是32线程,不过9950x多核应该还是更强大一些,单线程能力强一些
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Graphite    时间: 2026-7-6 23:23
本帖最后由 Graphite 于 2026-7-6 23:25 编辑

1. 做计算别整大小核
譬如4+8或者8+16(暂时不讨论P+E+LPE更复杂的情况)。在你只用到用到P核对应线程的时候,很强大,用到E核,那么实际的速度是跟着短板来。更别提例如8+16,这后面16个小核本来就弱一半,为了并行24核的通信开销本身还比16核大,所以不如全大核,老E5更是一个极端的例子。

2. LAMMPS的并行问题很复杂,但是依然高性能大核不会有错
LAMMPS并行分为三种情况(1)纯CPU的情况,笨重的势函数并且不能GPU/在特定体系不适合GPU,问题略类似于如Gaussian和Gromacs(硬拉CPU)等软件。(2)多CPU+GPU混合情况(GPU包+常见lj/coul势能),这个时候不是拉起的CPU线程数越多越好,可能4/8线程是甜点,依旧高主频没有错。(3)只能单线程拉GPU或多CPU意义不大的情况(KOKKOS包、ReaxFF),纯看单核性能,如果磁盘IO读写大或者有不能并行的因素(例如ReaxFF的输出分子数:图论问题、高频大体系轨迹输出、各种fix和modify等等),高主频绝对优势。

你上面的图也很能说明问题了,现阶段就是9950X3D / 9950X3D2。既然都5080了,综合成本肯定是2万以上,别折磨自己。散热电源整好点。
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我说你慢了!    时间: 2026-7-20 10:37
Graphite 发表于 2026-7-6 23:23
1. 做计算别整大小核
譬如4+8或者8+16(暂时不讨论P+E+LPE更复杂的情况)。在你只用到用到P核对应线程的时 ...

谢谢老师的建议。听了sob老师和各位老师的建议后,我最后把CPU换成了9950X和技嘉B850M电竞雕,内存换成了DDR5 C32 6400MHz 48G*2。




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