计算化学公社

标题: 为何计算对称分子的2D-NICS平面图时对称部分的颜色会不同 [打印本页]

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Aocan    时间: 2026-6-10 21:59
标题: 为何计算对称分子的2D-NICS平面图时对称部分的颜色会不同
如题,按照文章http://sobereva.com/682”计算二位NICS平面图。所计算分子为QDI,分子式如图1;计算出来的二维图如图2;QDI分子是对称的,个人认为分子的电子结构以及其它性质也是上下左右对称的,为什么二维图计算出来上下部分的颜色会不一样呢

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KazusaT    时间: 2026-6-11 05:57
由于R的影响导致不完全是对称的吧,把R换成H试试?
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sobereva    时间: 2026-6-11 06:52
先弄清楚到底是否体系应该是平面的,如果你觉得应该纯平,GaussView里先做对称化后再优化,使得优化完的体系平面完全平行于某个笛卡尔平面
如果本来就不是完全纯平,用三个原子位置定义作图平面把你感兴趣的区域尽可能在平面图上充分展现出来就够了,甭管其它地方
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Aocan    时间: 2026-6-12 18:33
KazusaT 发表于 2026-6-11 05:57
由于R的影响导致不完全是对称的吧,把R换成H试试?

谢谢回复,已经发现问题所在了,是我的分子平面没有和笛卡尔坐标系平行
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Aocan    时间: 2026-6-12 18:35
sobereva 发表于 2026-6-11 06:52
先弄清楚到底是否体系应该是平面的,如果你觉得应该纯平,GaussView里先做对称化后再优化,使得优化完的体 ...

谢谢社长,已经发现问题所在了,是生成gjf输入文件时我的分子平面没有和笛卡尔坐标系XY平面平行,将其设置成平行后就是对称的了




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