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标题: Multiwfn 已有 ICSS-ZZ cube 文件，如何调整分子朝向、统一坐标轴区间且从零开始问题 [打印本页]

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Author: zxcvbnm0701 时间: 4 day ago
标题: Multiwfn 已有 ICSS-ZZ cube 文件，如何调整分子朝向、统一坐标轴区间且从零开始问题
本帖最后由 zxcvbnm0701 于 2026-8-9 21:00 编辑

各位老师好：
我参照博文《通过 Multiwfn 绘制等化学屏蔽表面 (ICSS) 研究芳香性》（http://sobereva.com/216）完成计算，已经得到 ICSS‑ZZ 的 cube 格点文件。
软件版本：Multiwfn 2026.6.2。
分子为单环共轭体系，整体几何为平面结构，优化完成后整个环平面与笛卡尔 XY 平面平行。现在绘制 XY、YZ 切面二维填色等值线图。
我希望达到的要求是：不希望重新做 ICSS 格点计算，希望基于现有 cube 文件处理，有 3 个疑问：

图像朝向问题
原始 cube 场数据本身没问题，绘制 XY 切面图时，环上杂原子落在坐标轴负方向一侧，论文插图需要杂原子出现在正方向一侧。
我尝试绘图菜单里‑1 Set translation and rotation of the map做 180° 旋转，发现该功能仅对 4/5/8 自定义拟合平面生效，我通过选项 8 拟合全部环原子，可以构造出几何等价于 XY 的自定义平面，此时旋转功能生效，但需要不断调试角度，可以得到处理后的 XY 切面；但对于 YZ 方向，很难构造出等价的自定义平面来完成朝向调整。
想问：在不重新计算、不重新生成 cube 文件的前提下，Multiwfn 绘图模块内部能否在选择切面的步骤之前直接解决该分子朝向问题？
多分子坐标轴区间统一
做多分子对比，不同分子的 XY 切面图，希望纵坐标显示区间完全统一，保证多图视觉尺度可比。请问 Multiwfn 内置绘图模块是否支持强制固定 X/Y 轴显示范围？
坐标轴从 0 起始
当前绘图坐标轴为正负对称（例如‑10 ~ 10 Bohr），我希望横、纵坐标都从 0 开始，不用正负双向。Multiwfn 平面绘图模块是否支持自定义非对称坐标轴起止？

如果 Multiwfn 内置绘图无法实现上述全部需求，可行方案是否只有两种：一是导出 plane.txt 格点数据，使用 Gnuplot/Origin 第三方软件后处理绘图；二是重新调整 gjf 分子几何、完整重算 ICSS 得到新 cube 文件？
谢谢各位老师！

作者
Author: sobereva 时间: 4 day ago
Multiwfn主功能4定义平面的界面里可以选择自己输入坐标原点和两个平移矢量，恰当定义就完了。并且也可以考虑ps
坐标轴从几开始没有读者或审稿人会关心，只会关心图片呈现的内容。你让Multiwfn不显示坐标轴上的文字和刻度都没关系（只显示原子标签位置就够了）

作者
Author: zxcvbnm0701 时间: 3 day ago

sobereva 发表于 2026-8-9 21:48
Multiwfn主功能4定义平面的界面里可以选择自己输入坐标原点和两个平移矢量，恰当定义就完了。并且也可以考 ...

好的，感谢老师，我补充一点疑问，导师要求希望多分子对比的 ICSS-ZZ XY 二维填色平面图，空间坐标轴的纵坐标尽量取相同区间，对比更直观，multiwfn 有解决办法吗，有没有哪个功能可以改横纵坐标区间范围。

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Author: sobereva 时间: 3 day ago

zxcvbnm0701 发表于 2026-8-10 13:38
好的，感谢老师，我补充一点疑问，导师要求希望多分子对比的 ICSS-ZZ XY 二维填色平面图，空间坐标轴的 ...

前面说了，Multiwfn里直接设原点、平移矢量、格点数，则作图平面完全由你自己控制

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Author: zxcvbnm0701 时间: 3 day ago

sobereva 发表于 2026-8-10 18:15
前面说了，Multiwfn里直接设原点、平移矢量、格点数，则作图平面完全由你自己控制

好的，谢谢老师！

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