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标题: 柔性扫面得到的能量最高点做过渡态初猜不是想要的结果 [打印本页]

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Author: xujian 时间: 2017-6-4 17:10
标题: 柔性扫面得到的能量最高点做过渡态初猜不是想要的结果
用柔性扫描的方法找过渡态，柔性扫描的两端是我要的反应物和产物，且只有一个极大值点，曲线光滑没有突变的点，如图一和二，将最高点作为初猜得到的过渡态却是图一的环状结构失去SO3的过渡态（IRC证实），请问这是什么原因导致的，谢谢！ps:柔性扫描的输出文件见附件。
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作者
Author: sobereva 时间: 2017-6-4 17:49
IRC输出文件压缩一下传上来

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Author: xujian 时间: 2017-6-5 08:31

sobereva 发表于 2017-6-4 17:49
IRC输出文件压缩一下传上来

麻烦sob老师 (, 下载次数 Times of downloads: 39)

作者
Author: sobereva 时间: 2017-6-5 09:13
当前IRC没问题，开环完了自发就直接进行SO3断裂。你的IRC曲线有肩峰，这经常预示着这个IRC包含不止一个stage

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Author: xujian 时间: 2017-6-5 09:27
本帖最后由 xujian 于 2017-6-5 09:39 编辑

sobereva 发表于 2017-6-5 09:13
当前IRC没问题，开环完了自发就直接进行SO3断裂。你的IRC曲线有肩峰，这经常预示着这个IRC包含不止一个stag ...

谢谢老师，那是不是意味着这两个结构之间不存在过渡态？您说意味着不止一个stage，通过何种方法可以把所有stage找全呢？

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Author: sobereva 时间: 2017-6-5 09:40

xujian 发表于 2017-6-5 09:27
谢谢老师，那是不是意味着这两个结构之间不存在过渡态？您说意味着不止一个stage，通过何种方法可以把所 ...

我是指这单一的IRC本来就包含两步过程，第一步过程是开环，有过渡态，第二步是SO3解离，这一步没过渡态，所以第一步完成后直接就解离了

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