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标题: GROMACS做能量最小化的问题 [打印本页]

作者
Author: 浅原问问 时间: 2017-6-13 16:33
标题: GROMACS做能量最小化的问题
老师们好，最近用gromacs跑动力学发现，在最小化的时候，有某些步数里面没有数据，但仍能正常结束得到em.log和em.gro。请问这会影响接下来的退火和MD吗？（多次跑动力学发现有时候md能继续进行，有时候不能。）请问这是不是和em中的缺失的步数有关呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2017-6-13 21:28
只要EM之后的结构合理，MD能正常跑起来，就没事
即便MD跑不起来也和这个没直接关系

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